See download stats for:    Bioconductor annotation packages    Bioconductor experiment packages    Bioconductor workflow packages

Download stats for Bioconductor software packages

This page was generated on 2023-12-01 00:26:42 -0500 (Fri, 01 Dec 2023).

The number reported next to each package name is the download score, that is, the average number of distinct IPs that “hit” the package each month for the last 12 months (not counting the current month).


Top 75

1BiocVersion (51787)
2BiocGenerics (50286)
3S4Vectors (49818)
4GenomeInfoDb (49555)
5IRanges (46337)
6Biobase (43887)
7zlibbioc (43312)
8XVector (42327)
9BiocParallel (42309)
10DelayedArray (40928)
11Biostrings (39807)
12GenomicRanges (37216)
13AnnotationDbi (35528)
14MatrixGenerics (35291)
15SummarizedExperiment (34160)
16KEGGREST (32466)
17limma (31334)
18BiocFileCache (22424)
19biomaRt (20948)
20GenomicAlignments (20732)
21Rhtslib (20444)
22Rsamtools (20235)
23annotate (19854)
24edgeR (19669)
25Rhdf5lib (19312)
26DESeq2 (19286)
27rtracklayer (18490)
28treeio (17475)
29rhdf5 (17440)
30ggtree (17386)
31graph (17236)
32rhdf5filters (17074)
33GenomicFeatures (16998)
34BiocIO (16337)
35enrichplot (15741)
36S4Arrays (15130)
37qvalue (15091)
38clusterProfiler (15059)
39fgsea (14537)
40DelayedMatrixStats (14530)
41DOSE (14419)
42genefilter (14249)
43GOSemSim (14013)
44preprocessCore (14004)
45sparseMatrixStats (13586)
46SingleCellExperiment (13228)
47beachmat (13040)
48geneplotter (12540)
49ComplexHeatmap (11872)
50BSgenome (11348)
51multtest (10936)
52BiocSingular (10625)
53ScaledMatrix (10612)
54HDF5Array (10257)
55ProtGenerics (10206)
56impute (9802)
57Rgraphviz (9217)
58AnnotationHub (9033)
59RBGL (8945)
60scuttle (8922)
61interactiveDisplayBase (8800)
62AnnotationFilter (8614)
63ensembldb (8611)
64BiocNeighbors (8452)
65GEOquery (8262)
66VariantAnnotation (8041)
67affy (7889)
68affyio (7782)
69GSEABase (7764)
70sva (6432)
71ExperimentHub (6212)
72scater (5768)
73BiocStyle (5746)
74ShortRead (5716)
75KEGGgraph (5198)

All software packages

All software package stats in one file: bioc_pkg_stats.tab

All software package download scores in one file: bioc_pkg_scores.tab

See Download stats for Bioconductor software repository (all packages combined)

A

a4 (55)
a4Base (81)
a4Classif (55)
a4Core (92)
a4Preproc (107)
a4Reporting (73)
a4reporting (0)
ABAData (1)
ABAEnrichment (6)
abaenrichment (0)
ABarray (52)
abc (1)
abc.data (0)
abe (0)
abind (1)
abseqR (44)
ABSOLUTE (0)
ABSSeq (80)
acde (69)
ACE (71)
acepack (1)
aCGH (117)
ACME (67)
actuar (1)
ada (0)
adabag (1)
ADaCGH2 (48)
ADAM (49)
ADAMgui (49)
adaptest (2)
adductomicsR (46)
ade4 (2)
adegenet (1)
adegraphics (1)
adephylo (1)
ADGofTest (1)
ADImpute (61)
admiral (1)
admiral.test (1)
admiraldev (1)
admisc (24)
admixtools (0)
ADMM (1)
adSplit (45)
adverSCarial (5)
AER (1)
afex (1)
affio (0)
AffiXcan (44)
affxparser (1439)
affy (7889)
affycomp (68)
AffyCompatible (34)
affyContam (46)
affycoretools (341)
affydata (1)
AffyExpress (3)
affyILM (42)
affyio (7782)
affylmGUI (50)
affyPara (4)
affypdnn (3)
affyPLM (1398)
affyQCReport (9)
affyqcreport (0)
AffyRNADegradation (44)
AffyTiling (2)
AGDEX (46)
aggregateBioVar (54)
aggregation (0)
AGHmatrix (1)
Agi4x44PreProcess (3)
agilp (97)
AgiMicroRna (127)
agimicrorna (0)
agricolae (4)
AHMassBank (18)
AICcmodavg (1)
AIMS (349)
AIPW (1)
airpart (41)
airr (0)
airway (1)
akima (1)
alabama (1)
alabaster (25)
alabaster.base (26)
alabaster.bumpy (22)
alabaster.files (4)
alabaster.mae (25)
alabaster.matrix (23)
alabaster.ranges (21)
alabaster.sce (19)
alabaster.schemas (25)
alabaster.se (21)
alabaster.spatial (21)
alabaster.string (21)
alabaster.vcf (19)
alakazam (0)
ald (1)
ALDEx2 (978)
aldvmm (1)
alembic (1)
alevinQC (75)
AlgDesign (1)
alkahest.generic (1)
ALL (8)
AllelicImbalance (64)
alluvial (1)
almanac (1)
AlphaBeta (44)
alphahull (1)
alphashape3d (1)
alpine (68)
ALPS (3)
AlpsNMR (56)
alr4 (1)
alsace (6)
altcdfenvs (48)
amap (1)
AMARETTO (58)
ambient (1)
Amelia (1)
AmesHousing (1)
amgen.okta.client (0)
amgsafetyvis (0)
amlogger (0)
AMOUNTAIN (67)
amplican (59)
ampliQueso (1)
AnalysisPageServer (2)
anamiR (3)
Anaquin (49)
ANCOMBC (1030)
AneuFinder (74)
AneuFinderData (0)
ANF (44)
animalcules (105)
animation (1)
annaffy (206)
AnnBuilder (1)
anndata (1)
annmap (47)
annotate (19854)
annotation (1)
AnnotationDbi (35528)
annotationdbi (1)
AnnotationFilter (8614)
AnnotationForge (2462)
AnnotationFuncs (6)
AnnotationHub (9033)
AnnotationHubData (240)
annotationTools (76)
annotatr (404)
anota (51)
anota2seq (56)
anRichment (1)
anticlust (1)
antiProfiles (59)
AnVIL (556)
AnVILBilling (51)
AnVILPublish (41)
AnVILWorkflow (18)
anytime (3)
aod (1)
APAlyzer (55)
apcluster (1)
apComplex (44)
apcomplex (0)
ape (9)
apeglm (3113)
apexcharter (1)
APL (51)
aplot (15)
appgen (0)
applera (1)
appreci8R (51)
aqp (1)
archive (1)
ArchR (1)
argparse (7)
argus.DS.Credentials (1)
argusDS.apc.utils (1)
argusDS.backtesting.engine (1)
argusDS.data (1)
argusDS.data.preparation (1)
argusDS.data.preparation2 (1)
argusDS.DB.manager.utilities (1)
argusDS.driver.importance (1)
argusDS.FCUtilities (1)
argusDS.FZ.SourceData (1)
argusDS.gamlss.forecast (1)
argusDS.gamlss.modelling (1)
argusDS.gamlss.testing (1)
argusDS.gamlss.utils (1)
argusDS.model.tools (1)
argusDS.PossibilityCurves.utils (0)
argusDS.shiny.utils (1)
argusDS.spread.trading.utils (1)
argusDS.Studio.APC (1)
argusDS.Studio.FC (1)
argusDS.Studio.MyStudio (1)
argusDS.Studio.permissions (1)
argusDS.Studio.utils (1)
argusDS.tabulator (0)
argusDS.trading.performance (1)
argusDS.TradingSignals (0)
argusDS.utilities (1)
arm (1)
aroma.affymetrix (6)
aroma.apd (6)
aroma.core (6)
aroma.light (1736)
ArrayExpress (382)
arrayexpress (1)
ArrayExpressHTS (18)
arrayhelpers (1)
arrayMagic (1)
arrayMvout (40)
arraymvout (0)
arrayop (1)
arrayQCplot (2)
arrayQuality (101)
arrayQualityMetrics (527)
arrayqualitymetrics (0)
ArrayTools (7)
ArrayTV (4)
ARRmNormalization (50)
arrow (10)
arsenal (1)
artMS (58)
arules (21)
ArvadosR (1)
ASAFE (55)
ASCAT (0)
ascii (1)
asciicast (1)
ASEB (56)
ASExtras4 (1)
ASGSCA (59)
ash (4)
ashr (1)
asht (1)
ASICS (61)
AsioHeaders (2)
askpass (39)
asmn (1)
asnipe (0)
ASpediaFI (18)
ASpli (75)
asremlPlus (1)
assert (1)
assertive.properties (2)
assertive.types (2)
assertr (1)
assertthat (1)
AssessORF (43)
ASSET (84)
ASSIGN (64)
AssotesteR (1)
ASURAT (51)
ATACCoGAPS (34)
ATACseqQC (306)
ATACseqTFEA (41)
ATE (0)
atena (54)
AtlasRDF (1)
ATR (1)
atSNP (46)
attachment (1)
attempt (1)
attract (44)
AUC (1)
AUCell (1866)
audio (1)
autonomics (47)
Autotuner (3)
av (1)
ava2 (1)
AWFisher (47)
aws (1)
aws.ec2metadata (1)
aws.s3 (4)
aws.signature (4)
awst (47)
azcore (1)
Azimuth (1)
AzureAuth (1)
AzureGraph (1)
AzureRMR (1)
AzureStor (1)

B

BaalChIP (49)
babelgene (1)
babelmixr2 (1)
babelwhale (1)
babynames (1)
BAC (39)
backports (66)
bacon (87)
bacr (0)
BADER (67)
badger (1)
BadRegionFinder (40)
BAGS (41)
baguette (1)
bain (1)
BalancedSampling (1)
ballgown (547)
bambu (218)
bamsignals (1012)
BANDITS (62)
bandle (46)
banocc (57)
barcodetrackR (43)
BART (1)
bartMachine (1)
bartMachineJARs (1)
base (0)
base64 (1)
base64enc (1)
base64url (1)
basecallQC (50)
basefun (1)
BaseSpaceR (59)
Basic4Cseq (44)
BASiCS (108)
BASiCStan (36)
BasicSTARRseq (47)
basilisk (3404)
basilisk.utils (3200)
batchelor (3324)
BatchJobs (1)
BatchQC (98)
batchtools (1)
BayesFactor (1)
BayesFM (1)
BayesianTools (0)
BayesKnockdown (39)
bayesm (3)
bayesmeta (1)
BayesPeak (6)
bayespeak (0)
BayesPen (0)
bayesplot (8)
bayesQR (1)
BayesSpace (175)
bayestestR (1)
BayesX (1)
bayNorm (69)
baySeq (387)
bayseq (0)
BB (1)
BBCAnalyzer (39)
BBmisc (1)
bbmle (1)
bbotk (0)
bbr (1)
bbr.bayes (1)
BCEE (0)
bcellViper (1)
BCRANK (52)
bcSeq (45)
BDgraph (0)
BDMMAcorrect (44)
bdsmatrix (1)
beachmat (13040)
beachmat.hdf5 (3)
beadarray (652)
beadarraySNP (49)
BeadDataPackR (667)
beaddatapackr (0)
BeadExplorer (1)
beanplot (1)
BEARscc (37)
BEAT (38)
BEclear (55)
bedr (0)
beepr (1)
beer (45)
beeswarm (1)
bench (1)
benchdamic (51)
benchmarkme (1)
benchmarkmeData (1)
benchr (1)
BentoBox (0)
Bessel (1)
bestNormalize (1)
betareg (1)
betr (3)
BeviMed (0)
bezier (1)
BG2 (22)
bgafun (2)
BgeeCall (42)
BgeeDB (75)
BGLR (1)
BGmix (50)
bgx (43)
BH (74)
BHC (96)
BiasedUrn (9)
bibtex (1)
BicARE (88)
biclust (1)
bife (1)
BiFET (41)
biganalytics (1)
bigassertr (1)
bigD (1)
bigdist (1)
BiGGR (43)
biglasso (1)
biglm (1)
biglmm (1)
BigMatrix (0)
bigmelon (49)
bigmemory (1)
bigmemory.sri (1)
bigmemoryExtras (4)
bigparallelr (1)
bigPint (60)
bigreadr (1)
bigrquery (9)
bigsnpr (1)
bigsparser (1)
bigstatsr (1)
bigutils (1)
bigutilsr (1)
billboarder (2)
bim (1)
BiMax (1)
BindingSiteFinder (46)
bindr (1)
bindrcpp (1)
binGroup (1)
binom (1)
binr (0)
bio3d (1)
bioassayR (49)
biobank (1)
Biobase (43887)
biobase (1)
biobroom (159)
biobtreeR (55)
bioc::GenomeInfoDbData (1)
bioCancer (53)
BioCartaImage (2)
BiocBaseUtils (3288)
BiocBook (2)
BiocBookDemo (1)
BiocCaseStudies (3)
BiocCheck (1406)
biocDatasets (1)
BiocDockerManager (48)
BiocFHIR (36)
BiocFileCache (22424)
BiocGenerics (50286)
BioCGenerics (0)
biocGraph (87)
BiocHail (17)
BiocHubsShiny (36)
BiocInstaller (617)
Biocinstaller (0)
biocinstaller (1)
BiocInstallerf (0)
BiocIO (16337)
biocLite (0)
BiocManager (115)
BiocNeighbors (8452)
biocneighbors (1)
BiocOncoTK (59)
Bioconductor (1)
bioconductor (1)
bioconductor-geomxtools (0)
BioCor (63)
BiocParallel (42309)
BiocPkgTools (143)
BiocSet (186)
BiocSingular (10625)
BiocSklearn (49)
BiocStyle (5746)
biocthis (185)
BiocVersion (51787)
Biocversion (1)
biocversion (1)
biocViews (4044)
BiocWorkflowTools (160)
biodb (111)
biodbChebi (44)
biodbExpasy (36)
biodbHmdb (48)
biodbKegg (59)
biodbLipidmaps (36)
biodbMirbase (36)
biodbNcbi (40)
biodbNci (34)
biodbUniprot (41)
bioDist (194)
BioGenerics (1)
Biogenerics (1)
biom (0)
biomanager (0)
biomaRt (20948)
biomart (0)
biomartr (1)
BioMedR (1)
biomformat (4848)
BioMM (40)
BioMVCClass (41)
biomvRCNS (21)
BioNAR (43)
BioNERO (114)
BioNet (202)
bionet (0)
BioNetStat (58)
BioPlex (4)
BioQC (103)
BioSeqClass (5)
biosigner (66)
biostatR (1)
biostatUtil (0)
Biostrings (39807)
biostrings (0)
BiostringsCinterfaceDemo (0)
biosvd (2)
BioTIP (44)
biotmle (50)
BioVersion (1)
biovizBase (4992)
BiRewire (105)
birta (5)
birte (1)
biscuiteer (45)
BiSeq (62)
bit (34)
bit64 (7)
bitops (3)
BitSeq (28)
bizdays (1)
blacksheepr (44)
BlakerCI (1)
blastula (1)
blavaan (1)
blima (39)
BLMA (47)
blme (5)
blob (80)
blockcluster (1)
blockForest (0)
blockmodeling (1)
blogdown (1)
BloodGen3Module (59)
bluster (3830)
BMA (1)
BMisc (1)
BMix (0)
bmp (1)
bnbc (41)
bnem (38)
bnlearn (1)
BOBaFIT (38)
BOIN (1)
bold (1)
bookdown (22)
boot (22)
bootstrap (1)
borealis (32)
Boruta (0)
botor (1)
box (5)
bpcp (1)
BPRMeth (47)
BradleyTerry2 (1)
BRAIN (88)
brainflowprobes (37)
brainImageR (1)
BrainSABER (16)
BrainStars (2)
branchpointer (57)
brave (1)
breakpointR (51)
brendaDb (40)
brew (60)
BRGenomics (128)
brglm (1)
brglm2 (1)
bricks (1)
brickster (1)
bridge (17)
BridgeDbR (77)
bridgedist (0)
bridgesampling (1)
brio (2)
brms (1)
brmsmargins (1)
Brobdingnag (1)
broman (1)
broom (85)
broom.helpers (3)
broom.mixed (1)
BrowserViz (120)
BrowserVizDemo (1)
bs4Dash (4)
BSgenome (11348)
BSGenome (1)
BSgenome.Celegans.UCSC.ce2 (1)
BSgenome.Cfamiliaris.UCSC.canFam3 (4)
BSgenome.Drerio.UCSC.danRer11 (0)
BSgenome.Ggallus.ENSEMBL.galGal6 (1)
BSgenome.Hsapiens.1000genomes.hs37d5 (1)
BSgenome.Hsapiens.NCBI.GRCh38 (1)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19 (5)
BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 (8)
BSgenome.Mmul10.SIVmac251 (1)
BSgenome.Mmulatta.NCBI.mmul10.tmp (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10 (5)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm39 (1)
BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 (0)
BSgenome.Omela.CUSTOM.oenMel1.1 (1)
BSgenomeForge (26)
BSgenomes (1)
bsicons (1)
bslib (98)
bsplus (1)
bsseq (1196)
bst (0)
btergm (1)
BubbleTree (45)
BufferedMatrix (60)
BufferedMatrixMethods (43)
bugsigdbr (130)
BUMHMM (37)
bumphunter (2330)
BumpyMatrix (321)
BUS (41)
BUScorrect (39)
BUSpaRse (184)
BUSseq (39)
butcher (1)
BuxcoR (0)
bvls (1)
BWStest (1)

C

C50 (1)
ca (3)
cache (1)
cachem (104)
CaDrA (5)
CAEN (31)
CAFE (42)
CAGEfightR (93)
cageminer (39)
CAGEr (98)
cAIC4 (1)
Cairo (4)
CALIB (3)
calib (0)
calibrate (0)
callr (65)
callthat (1)
calm (52)
CAM (1)
CAMERA (419)
campsis (1)
campsismod (1)
CAMTHC (2)
canceR (47)
cancerclass (59)
CancerInSilico (25)
CancerMutationAnalysis (3)
CancerSubtypes (168)
CAnD (7)
candisc (1)
canvasXpress (0)
caOmicsV (4)
caper (0)
capsidr (0)
car (54)
carData (2)
cardelino (47)
Cardinal (124)
CardinalIO (4)
caret (50)
CARNIVAL (131)
carrier (1)
casebase (1)
casper (39)
castor (1)
CATALYST (378)
catboost (0)
catdata (1)
Category (1750)
category (0)
categoryCompare (42)
caTools (2)
CATT (1)
causaldata (1)
CausalR (64)
cba (1)
cbaf (41)
CBEA (38)
cBioPortalData (380)
CBNplot (36)
cbpManager (41)
CBPS (1)
ccaPP (1)
ccdata (7)
ccdrAlgorithm (1)
ccfindR (76)
ccImpute (37)
ccmap (65)
CCPlotR (2)
CCPROMISE (39)
ccrepe (89)
ccube (0)
CDI (2)
cdip.datastore (1)
CDr (1)
celaref (59)
celda (442)
CellaRepertorium (52)
CellBarcode (41)
cellbaseR (53)
CellBench (112)
celldex (1)
cellGrowth (3)
cellHTS (2)
cellHTS2 (116)
CelliD (150)
cellity (49)
CellMapper (42)
cellmigRation (48)
CellMixS (67)
CellNOptR (85)
cellnoptr (0)
cellranger (1)
cellscape (50)
CellScore (38)
CellTrails (42)
cellTree (20)
cellxgenedp (137)
cem (0)
CEMiTool (117)
censcyt (42)
censReg (1)
Cepo (81)
ceRNAnetsim (47)
CeTF (61)
CexoR (38)
CFAssay (56)
cfdnakit (4)
cfDNAPro (42)
cfTools (18)
cgam (1)
cgdsr (1)
CGEN (65)
CGHbase (343)
CGHcall (314)
cghFLasso (0)
cghMCR (49)
CGHnormaliter (41)
CGHregions (56)
ChAMP (554)
ChAMPdata (0)
changepoint (1)
CHARGE (2)
charm (3)
checkmate (16)
checkr (0)
ChemmineOB (290)
ChemmineR (833)
chemminer (0)
chemometrics (1)
CHETAH (83)
ChIC (32)
Chicago (81)
chihaya (25)
chimera (3)
chimeraviz (78)
ChIPanalyser (39)
ChIPComp (49)
chipenrich (94)
ChIPexoQual (39)
ChIPpeakAnno (810)
ChIPQC (344)
ChIPseeker (1696)
chipseq (515)
ChIPseqR (69)
ChIPSeqSpike (5)
ChIPsim (70)
ChIPXpress (47)
chk (2)
chopsticks (88)
CHORD (0)
chroGPS (2)
chromDraw (40)
ChromHeatMap (57)
chromote (2)
ChromoViz (1)
chromPlot (69)
ChromSCape (50)
chromstaR (73)
chromswitch (36)
chromVAR (1005)
chron (2)
CHRONOS (45)
cibersort (1)
cicero (203)
CIMICE (39)
CINdex (54)
cindex (0)
circlesize (1)
circlize (3)
circRNAprofiler (54)
CircSeqAlignTk (30)
circular (0)
cisPath (55)
CiteFuse (88)
Ckmeans.1d.dp (1)
class (61)
ClassDiscovery (1)
ClassifyR (116)
classInt (14)
cleanrmd (1)
cleanUpdTSeq (48)
cleaver (151)
clevRvis (24)
cli (117)
clinfun (1)
ClinicalQc (1)
clinPK (0)
ClinViz (1)
clippda (40)
clipper (79)
clipr (38)
cliProfiler (42)
cliqueMS (79)
clisymbols (1)
clock (21)
Clomial (51)
Clonality (41)
clonotypeR (10)
clst (48)
clstutils (46)
clubSandwich (1)
clue (15)
CluMSID (48)
clustComp (57)
cluster (56)
clusterCrit (1)
clusterExperiment (318)
ClusterFoldSimilarity (0)
clusterGeneration (2)
ClusterJudge (53)
clustermq (2)
clusterprofielr (0)
clusterProfiler (15059)
clusterprofiler (1)
ClusterProfiler (0)
ClusterR (1)
clusterRepro (0)
clusterSeq (24)
ClusterSignificance (52)
clusterSim (1)
clusterStab (69)
clusthaplo (1)
clustifyr (124)
ClustIRR (2)
clustMixType (1)
clustree (1)
clv (1)
clValid (1)
CMA (103)
cmapR (328)
cmdstanr (1)
CMplot (1)
cmprsk (1)
CmsAnalytics (1)
cn.farms (46)
cn.mops (183)
CNAnorm (47)
cnanorm (0)
CNAqc (0)
CNEr (2091)
CNORdt (39)
CNORfeeder (42)
CNORfuzzy (39)
cNORM (0)
CNORode (64)
CNPBayes (2)
CNTools (82)
cntools (0)
CNVfilteR (43)
CNVgears (51)
cnvGSA (40)
CNViz (38)
CNVMetrics (35)
CNVPanelizer (51)
CNVRanger (73)
CNVrd2 (37)
CNVtools (3)
cnvtools (0)
cobalt (1)
cobindR (2)
cobs (1)
CoCiteStats (35)
COCOA (43)
coda (2)
codelink (54)
codetools (19)
CODEX (67)
coexnet (19)
CoGAPS (122)
cogena (76)
cogeqc (52)
Cogito (38)
coGPS (53)
COHCAP (60)
coin (1)
cola (121)
collapse (1)
collections (1)
CollessLike (0)
coloc (9)
colorfulVennPlot (1)
colorRamps (6)
colorspace (34)
colortools (1)
colourpicker (3)
colourvalues (1)
comapr (39)
combi (40)
combinat (1)
coMET (69)
coMethDMR (38)
ComICS (0)
commentr (1)
common (1)
CommonJavaJars (1)
commonmark (90)
compareDF (1)
compareGroups (1)
compartmap (41)
COMPASS (58)
compcodeR (71)
compEpiTools (49)
CompGO (3)
compiler (0)
ComplexHeatmap (11872)
complexheatmap (1)
compositions (2)
CompoundDb (329)
CompQuadForm (1)
ComPrAn (46)
compSPOT (2)
compute.es (1)
concaveman (1)
conclus (16)
concordexR (35)
condcomp (1)
condiments (56)
conditionz (1)
condMVNorm (1)
coneproj (1)
conf.design (1)
CONFESS (39)
config (7)
confintr (1)
conflicted (9)
connectwidgets (1)
conquer (2)
consensus (54)
ConsensusClusterPlus (2682)
consensusDE (43)
consensusOV (57)
consensusSeekeR (74)
consICA (42)
consort (1)
ConsRank (1)
CONSTANd (54)
contfrac (1)
contiBAIT (38)
conumee (130)
convert (115)
coop (1)
copa (41)
COPDSexualDimorphism (1)
copula (1)
copynumber (259)
CopyNumber450k (1)
CopyNumberPlots (86)
CopywriteR (30)
coRdon (119)
CoRegFlux (2)
CoRegNet (62)
CoreGx (174)
Cormotif (37)
CorMut (3)
coRNAi (3)
coro (1)
corpcor (1)
corpora (1)
corral (64)
correlation (1)
CORREP (56)
corrplot (2)
corrr (1)
coseq (97)
CoSIA (26)
cosmiq (37)
cosmo (2)
cosmoGUI (2)
cosmosR (58)
COSNet (60)
COTAN (54)
CountClust (5)
countrycode (7)
countsimQC (81)
covEB (37)
coveffectsplot (1)
CoverageView (54)
covr (57)
covRNA (38)
CovSel (0)
cowplot (2)
coxme (1)
coxphf (1)
cplm (1)
cpm (1)
cpp11 (86)
cpvSNP (40)
cqn (211)
cranlogs (1)
crayon (74)
crch (1)
creatr (1)
credentials (14)
crew (1)
crew.cluster (1)
CRImage (53)
CRISPR.shinyapp (1)
crisprBase (82)
crisprBowtie (77)
crisprBwa (46)
crisprDesign (66)
crisprScore (85)
CRISPRseek (90)
crisprseekplus (33)
CrispRVariants (75)
crisprVerse (53)
crisprViz (60)
crlmm (116)
crop (1)
crossdes (1)
CrossICC (2)
crossmatch (1)
crossmeta (71)
crosstable (0)
crosstalk (51)
crrri (0)
crrry (0)
crul (4)
CSAR (69)
csaw (392)
csawBook (5)
csdR (40)
csSAM (0)
CSSP (56)
CSSQ (37)
csv (1)
ctc (244)
CTdata (23)
CTDquerier (41)
ctgGEM (3)
ctmle (0)
cTRAP (45)
ctree (0)
ctsGE (42)
CTSV (37)
cubature (1)
cubelyr (1)
Cubist (1)
cummeRbund (221)
cummerbund (1)
CuratedAtlasQueryR (5)
curatedMetagenomicData (0)
curl (146)
customCMPdb (38)
customProDB (58)
cvar (1)
cvAUC (1)
CVE (2)
cvms (1)
CVST (1)
CVXR (1)
cxAnalysis (0)
cyanoFilter (33)
cycle (38)
cyclocomp (6)
cydar (64)
CytoDx (41)
cytofast (3)
cytofkit (18)
CyTOFpower (37)
cytofQC (18)
CytoGLMM (48)
cytoKernel (34)
cytolib (2319)
cytomapper (202)
cytoMEM (58)
CytoML (529)
CytoPipeline (25)
CytoPipelineGUI (2)
CytoTRACE (1)
CytoTree (22)
cytoviewer (35)

D

D0.db (1)
D2C (1)
d3Network (0)
d3r (1)
dada2 (2123)
dae (1)
dagitty (1)
dagLogo (50)
daMA (56)
DAMEfinder (40)
DaMiRseq (57)
DAPAR (90)
DART (61)
DASC (1)
DASiR (2)
dasnormalize.iomel (1)
dasper (35)
data.table (71)
data.tree (1)
DataEditR (1)
datamods (4)
DataOmnio (1)
datapipeline (1)
datasets (0)
datawizard (2)
DAVIDQuery (3)
dbaccess (0)
dbarts (1)
DBChIP (5)
DBI (26)
DBItest (1)
dbplyr (71)
dbscan (2)
dcanr (83)
DCATS (6)
DCchoice (1)
dcdatr (1)
dce (46)
dcGSA (40)
DChIPRep (2)
ddalpha (1)
DDCompanion (1)
ddCt (79)
ddgraph (2)
DDiGGER (0)
ddPCRclust (43)
deal (0)
dearseq (116)
debCAM (51)
debrowser (112)
debugme (1)
DECIPHER (2344)
deco (19)
DEComplexDisease (19)
decompTumor2Sig (71)
DeconRNASeq (183)
decontam (1355)
decontX (3)
deconvR (47)
decor (1)
decoupleR (704)
DEDS (3)
Deducer (1)
DeepBlueR (48)
DeepPINCS (38)
deepSNV (96)
DEFormats (217)
DegNorm (48)
DEGraph (42)
degraph (0)
DEGreport (463)
DEGseq (159)
degseq (0)
Delaporte (0)
DelayedArray (40928)
DelayedDataFrame (44)
DelayedMatrixStats (14530)
DelayedRandomArray (45)
DelayedTensor (35)
deldir (18)
DELocal (21)
deltaCaptureC (39)
deltaGseg (47)
DeMAND (55)
DeMixT (73)
demuxmix (125)
demuxSNP (8)
dendextend (49)
DendSer (1)
dendsort (1)
densEstBayes (3)
densityClust (0)
densvis (2432)
DEoptim (1)
DEoptimR (10)
DEP (443)
DepecheR (270)
DepInfeR (36)
DEqMS (198)
derfinder (466)
derfinderHelper (463)
derfinderPlot (86)
Deriv (1)
desc (70)
DEScan2 (41)
descr (1)
descsuppR (0)
DescTools (2)
DESeq (285)
deseq (0)
DESeq2 (19286)
deseq2 (1)
designmatch (1)
DEsingle (256)
deSolve (45)
DESpace (20)
destiny (667)
DEsubs (44)
devEMF (1)
devtools (55)
DEWSeq (47)
DEXICA (0)
DExMA (51)
DEXSeq (1316)
dexus (3)
dfidx (1)
dfoptim (1)
DFP (37)
DHARMa (1)
diagram (1)
DiagrammeR (2)
DiagrammeRsvg (1)
DIAlignR (45)
dials (8)
DiceDesign (1)
DiceKriging (1)
diceR (1)
dichromat (1)
did (1)
DiffBind (1006)
diffcoexp (71)
diffcyt (230)
diffdf (1)
DifferentialRegulation (40)
diffGeneAnalysis (46)
diffgeneanalysis (0)
diffHic (90)
DiffLogo (65)
diffloop (36)
diffobj (2)
diffuStats (56)
diffUTR (35)
diffviewer (1)
digest (153)
diggit (43)
dimRed (1)
Dino (40)
diptest (1)
dir.expiry (3122)
directlabels (1)
Director (48)
DirichletMultinomial (3215)
discordant (66)
DiscoRhythm (52)
DiscriMiner (0)
disk.frame (1)
distances (1)
distill (1)
distillery (0)
distinct (105)
distr (0)
distr6 (0)
distrEx (0)
distributional (8)
DistributionUtils (1)
distro (1)
dittodb (1)
dittoSeq (951)
divergence (34)
diveRsity (0)
djvdj (1)
dks (45)
dlookr (1)
dlstats (1)
dm (1)
DMCFB (35)
DMCHMM (38)
DMRcaller (66)
DMRcate (771)
DMRcatedata (0)
DMRforPairs (37)
DMRScan (36)
dmrseq (127)
DMwR (0)
DNABarcodeCompatibility (36)
DNABarcodes (142)
DNAcopy (4725)
dnacopy (1)
DNAfusion (37)
DNaseR (1)
DNAshapeR (65)
dndscv (0)
do (1)
DO.db (5)
doBy (1)
dockerfiler (1)
docopt (4)
DoE.base (1)
DoEstRare (1)
doFuture (1)
domainsignatures (2)
doMC (1)
DominoEffect (38)
doMPI (1)
doParallel (28)
doppelgangR (47)
DOQTL (3)
doRedis (1)
doRNG (1)
dorothea (1)
Doscheda (37)
DOSE (14419)
Dose (1)
DoseFinding (1)
doseR (37)
doSNOW (1)
dotCall64 (2)
dotwhisker (1)
DoubletFinder (1)
doubletrouble (30)
downlit (18)
downloader (1)
downloadthis (1)
dparser (1)
DPClust (0)
dpclust3p (0)
dpeak (36)
dplyr (156)
dplyrb (0)
dqrng (11)
dr (0)
drake (2)
drat (1)
drawProteins (141)
drc (1)
DRDID (1)
dream (1)
dreamerr (1)
dreamlet (3)
drgee (1)
DRIMSeq (313)
DriverNet (58)
DropletUtils (2478)
drosophila2probe (1)
DRR (1)
drugTargetInteractions (49)
DrugVsDisease (44)
dSimer (2)
DSS (1026)
dStruct (34)
DT (103)
DTA (64)
dtangle (0)
dtplyr (45)
DTRreg (0)
dtw (1)
dtwclust (1)
dualKS (3)
duckdb (1)
dummies (0)
Dune (36)
DupChecker (2)
dupRadar (88)
dyebias (40)
dygraphs (1)
dynamicTreeCut (1)
DynDoc (1122)
dyndoc (0)
dynfeature (1)
dynlm (1)
dynplot (1)
dynpred (1)
dynwrap (1)

E

e1071 (10)
earth (1)
easier (90)
EasyABC (0)
EasyCellType (47)
easyENTIM (1)
easylift (2)
easypar (0)
EasyqpcR (5)
easyreporting (50)
easyRNASeq (60)
easyrnaseq (0)
easystats (1)
ebal (1)
EBarrays (128)
EBcoexpress (54)
EBImage (2373)
ebimage (0)
EBSEA (40)
EBSeq (355)
EBSeqHMM (56)
Ecdat (1)
Ecfun (1)
echarts4r (7)
ecodist (1)
ecolitk (40)
ECOSolveR (1)
EDASeq (1565)
edd (2)
EDDA (2)
edge (84)
edgeR (19669)
edger (1)
EDIRquery (18)
eds (216)
eegc (34)
effects (1)
effectsize (2)
EGAD (52)
egg (4)
EGSEA (141)
eha (1)
eiR (42)
eisa (4)
eisaR (85)
elasticsearchr (1)
ELBOW (3)
ellipse (47)
ellipsis (9)
elliptic (1)
ELMER (181)
emayili (1)
embed (1)
EMD (1)
emdbook (3)
emdist (1)
EMDomics (57)
emmeans (54)
EMMREML (1)
EmpiricalBrownsMethod (84)
emulator (1)
enc (0)
encode (1)
ENCODExplorer (3)
encryptr (1)
energy (1)
engitix.singlecell.db (0)
engitomixmk2 (1)
english (1)
EnhancedVolcano (3701)
enhancedvolcano (1)
enhancerHomologSearch (40)
EnMCB (31)
ENmix (171)
EnrichedHeatmap (505)
EnrichmentBrowser (386)
enrichplot (15741)
enrichR (1)
enrichTF (62)
enrichViewNet (2)
enrichwith (1)
EnsDb.Hsapiens.v75 (4)
EnsDb.Hsapiens.v79 (3)
EnsDb.Hsapiens.v86 (5)
EnsDb.Mmusculus.v79 (1)
ensembldb (8611)
ensemblVEP (108)
entropy (1)
ENVISIONQuery (2)
EnvStats (1)
Epi (1)
epialleleR (44)
EpiCluster (0)
EpiCompare (46)
epidecodeR (35)
EpiDISH (385)
epigenomix (39)
epigraHMM (43)
epihet (16)
EpiMix (31)
epimutacions (42)
epiNEM (56)
EpiNow2 (0)
epiR (2)
epistack (41)
epistasisGA (33)
EpiStats (1)
epitools (1)
EpiTxDb (47)
epivizr (50)
epivizrChart (42)
epivizrData (66)
epivizrServer (90)
epivizrStandalone (52)
equatags (1)
equate (1)
equivalence (1)
erccdashboard (51)
ergm (1)
ergm.count (0)
erify (1)
erma (64)
ERSSA (40)
esATAC (77)
escape (217)
escheR (22)
esetVis (56)
esquisse (1)
estimability (6)
estimatr (1)
estmeansd (1)
etm (1)
eudysbiome (34)
europepmc (1)
evaluate (141)
EValue (1)
evaluomeR (42)
evd (1)
EventPointer (48)
eventTrack (1)
EWCE (121)
Exact (1)
exact2x2 (1)
exactci (1)
exactRankTests (1)
ExCluster (36)
ExiMiR (41)
exomeCopy (204)
exomecopy (0)
ExomeDepth (1)
exomePeak (8)
exomePeak2 (91)
exonfindR (0)
exonmap (3)
ExperimentHub (6212)
ExperimentHubData (205)
ExperimentSubset (37)
expint (1)
explorase (4)
explore (1)
ExploreModelMatrix (123)
ExplorOMICS (0)
expm (2)
ExpressionAtlas (100)
ExpressionView (2)
exprExternal (1)
expsmooth (0)
expss (5)
externalVector (2)
extraChIPs (40)
extraDistr (4)
extrafont (1)
extrafontdb (1)
extraInserts (1)
extraoperators (1)
extraTrees (0)
extRemes (0)

F

fabia (126)
fabletools (1)
facets (0)
facopy (1)
factDesign (41)
factoextra (1)
FactoInvestigate (1)
FactoMineR (44)
Factoshiny (1)
factR (39)
fail (0)
FamAgg (55)
famat (38)
fansi (85)
faraway (1)
farms (56)
farver (9)
fastcluster (1)
fastDummies (11)
fastGHQuad (1)
fastICA (1)
fastLiquidAssociation (41)
fastmap (45)
fastmatch (9)
FastqCleaner (80)
fastreeR (66)
fastseg (659)
fastshap (1)
fasttime (1)
fastverse (1)
fauxpas (1)
fBasics (1)
fbat (2)
FCBF (67)
fCCAC (36)
fCI (49)
fcoex (48)
fcScan (38)
FD (1)
fda (6)
FDb.InfiniumMethylation.hg19 (4)
fdrame (55)
fdrtool (1)
fds (4)
FEAST (89)
feather (1)
FeatSeekR (24)
feature (3)
FedData (1)
fedup (37)
feisr (1)
FELLA (121)
FEM (21)
fenr (2)
ff (51)
ffbase (0)
FField (0)
ffpe (51)
fftw (0)
fftwtools (0)
fGarch (1)
fgga (36)
FGNet (75)
fgsea (14537)
fields (2)
filehash (1)
filelock (4)
filesstrings (1)
FilterFFPE (37)
finalfit (1)
FindIT2 (46)
FindMyFriends (4)
findpython (5)
finetune (1)
fingerprint (1)
FISHalyseR (38)
fishHook (0)
fishMod (0)
fishpond (320)
fit.models (1)
fitdistrplus (8)
FitHiC (65)
fixest (1)
flagme (41)
flair (1)
FLAMES (51)
flashClust (1)
flexclust (1)
flexdashboard (2)
flexmix (1)
flexsurv (1)
flexsurvcure (1)
flextable (10)
flipflop (2)
float (1)
flock (1)
flowAI (467)
flowBeads (38)
flowBin (37)
flowcatchR (39)
flowCHIC (38)
flowCL (17)
flowClean (204)
flowClust (763)
flowclust (1)
flowCore (2245)
FlowCore (1)
flowcore (1)
flowCut (74)
flowCyBar (51)
flowDensity (176)
flower (1)
flowFit (4)
flowFlowJo (3)
flowFP (73)
flowGate (28)
flowGraph (50)
flowMap (52)
flowMatch (42)
flowMeans (91)
flowMerge (61)
flowPeaks (127)
flowPhyto (1)
flowPloidy (43)
flowPlots (43)
flowQ (2)
flowq (0)
flowQB (2)
FlowRepositoryR (5)
FlowSOM (929)
FlowSorted.Blood.EPIC (7)
FlowSorted.CordBloodCombined.450k (7)
flowSpecs (48)
flowSpy (2)
flowStats (530)
flowTime (43)
flowTrans (53)
flowType (3)
flowUtils (42)
flowViz (939)
flowVS (82)
flowWorkspace (1127)
flowworkspace (0)
flowWorkspaceData (0)
flux (1)
fma (0)
fmcsR (196)
FME (1)
fmrs (91)
fmsb (1)
FMStable (1)
fmtr (1)
FNN (7)
fobitools (36)
focalCall (2)
foghorn (1)
FoldGO (38)
fontawesome (81)
fontBitstreamVera (1)
fontcm (1)
fontLiberation (1)
fontquiver (1)
forcats (15)
foreach (6)
forecast (2)
foreign (18)
forestplot (1)
forestploter (0)
fork (1)
formatR (16)
formattable (1)
formatters (1)
Formula (5)
formula.tools (1)
forrester.metadata (1)
fortunes (1)
fossil (0)
FourCSeq (4)
fpc (1)
fpp (0)
fracdiff (1)
FRASER (95)
frenchFISH (45)
fresh (4)
FrF2 (1)
FRGEpistasis (49)
frma (95)
frmaTools (45)
fs (162)
FScanR (45)
fst (1)
fstcore (1)
fTrading (1)
FunChIP (43)
FunciSNP (3)
fungible (1)
funtooNorm (36)
furrr (8)
FuseSOM (42)
futile.logger (1)
futile.options (1)
future (66)
future.apply (28)
future.batchtools (1)
future.callr (3)
fuzzyjoin (1)
fwb (1)

G

g3viz (1)
GA (1)
GA4GHclient (43)
ga4ghclient (0)
GA4GHshiny (36)
gada (0)
gaga (49)
gage (838)
gaggle (35)
gaia (30)
gam (1)
gamboostLSS (1)
gamlss (1)
gamlss.data (1)
gamlss.dist (1)
gamlss.tr (0)
gamm4 (1)
gap (1)
gap.datasets (1)
gapfill (0)
GAPGOM (4)
gapminder (1)
GAprediction (52)
garfield (58)
gargle (64)
GARS (38)
gaston (1)
GateFinder (37)
gatom (2)
gaucho (2)
gbm (1)
gbRd (1)
GBScleanR (38)
gbutils (1)
gcapc (47)
gcatest (39)
gclus (1)
gCMAP (4)
gCMAPWeb (3)
gCrisprTools (43)
gcrma (1308)
GCS (1)
GCSConnection (3)
GCSFilesystem (7)
GCSscore (36)
gdata (8)
GDCRNATools (220)
gdistance (0)
gDNAx (3)
gDR (5)
gDRcore (5)
gDRimport (6)
gDRstyle (7)
gDRutils (6)
GDSArray (74)
gdsfmt (1944)
gdtools (9)
gee (1)
geecc (2)
geepack (1)
geigen (1)
geiger (0)
GEM (56)
gemini (52)
gemma.R (44)
gemtc (1)
GenABEL (3)
GenABEL.data (3)
genArise (47)
genbankr (175)
GENE.E (2)
gene2pathway (2)
GeneAccord (16)
GeneAnswers (18)
geneAttribution (39)
GeneBreak (49)
geneClassifiers (37)
GeneExpressionSignature (48)
genefilter (14249)
genefu (338)
GeneGA (38)
GeneGeneInteR (40)
GeneGroupAnalysis (2)
geneLenDataBase (8)
GeneMeta (60)
GeneNet (0)
GeneNetworkBuilder (52)
GeneOverlap (288)
geneplast (71)
geneplotter (12540)
GeneR (2)
GeneralizedHyperbolic (1)
geneRecommender (40)
GeneRegionScan (43)
GeneRfold (2)
generics (12)
geneRxCluster (40)
GeneSelectMMD (54)
GeneSelector (3)
GENESIS (297)
genesis (1)
GeneSpring (2)
GeneStructureTools (58)
geNetClassifier (81)
genetics (0)
GeneticsBase (2)
GeneticsDesign (3)
GeneticsPed (100)
GeneTonic (126)
GeneTraffic (2)
GeneTS (1)
geneXtendeR (44)
GENIE3 (1013)
genoCN (54)
GenoGAM (3)
genomation (546)
GenomAutomorphism (35)
GenomeBase (1)
GenomeGraphs (7)
GenomeInfoDb (49555)
genomeinfodb (0)
GenomeInfoDB (1)
GenomeInfoDbData (17)
genomeIntervals (108)
genomeintervals (0)
GenomelnfoDb (0)
genomes (62)
GenomicAlignments (20732)
genomicalignments (0)
GenomicDataCommons (1121)
GenomicDistributions (76)
GenomicDistributionsData (1)
GenomicFeatures (16998)
genomicfeatures (0)
GenomicFiles (974)
genomicInstability (38)
GenomicInteractionNodes (36)
GenomicInteractions (260)
GenomicOZone (38)
GenomicPlot (1)
GenomicRanges (37216)
GenomicScores (451)
GenomicSuperSignature (43)
GenomicTools (1)
GenomicTuples (39)
Genominator (4)
genoset (10)
genotypeeval (23)
GenoView (1)
genphen (4)
GenProSeq (32)
GenRank (2)
GenSA (1)
GenVisR (349)
GeoDiff (67)
geodiv (1)
GEOexplorer (54)
GEOfastq (57)
geohashTools (0)
geojson (1)
geojsonio (1)
geojsonsf (1)
GEOmap (3)
GEOmetadb (180)
geometadb (0)
geometries (3)
geometry (1)
geomorph (1)
geomtextpath (1)
GeomxTools (269)
GEOquery (8262)
geoquery (1)
GEoquery (1)
geoR (1)
geos (1)
GEOsearch (2)
geosphere (8)
GEOsubmission (38)
GeoTcgaData (33)
gep2pep (44)
gert (25)
gespeR (52)
gestate (1)
getDEE2 (48)
getip (1)
getopt (11)
GetoptLong (2)
getPass (1)
getSVCNVperGene0.94 (0)
gettz (1)
geva (48)
GEWIST (49)
gff3Plotter (1)
gfonts (1)
gg4way (2)
ggalluvial (1)
GGally (1)
gganimate (1)
GGBase (7)
ggbeeswarm (3)
ggbio (1922)
ggbreak (1)
ggcorrplot (1)
ggcyto (857)
ggdag (1)
ggdendro (5)
ggdist (1)
gge (1)
ggeasy (1)
ggeffects (2)
ggExtra (1)
ggfittext (1)
ggforce (3)
ggforestplot (0)
ggformula (1)
ggfortify (2)
ggfun (17)
gggenes (1)
ggh4x (1)
gghalves (1)
gghighlight (1)
ggimage (1)
gginnards (0)
ggiraph (1)
ggkegg (10)
ggm (1)
ggmanh (75)
ggmap (41)
ggmosaic (1)
ggmsa (396)
ggnetwork (1)
ggnewscale (11)
ggnewscales (1)
ggokabeito (1)
GGPA (40)
ggpattern (1)
ggplot (1)
ggplot2 (95)
ggplot2movies (1)
ggplotify (12)
ggpmisc (1)
ggPMX (1)
ggpointdensity (4)
ggpp (1)
ggprism (0)
ggpubr (11)
ggRandomForests (0)
ggraph (3)
ggrastr (5)
ggrepel (22)
ggridges (9)
ggsc (3)
ggsci (50)
ggseqlogo (4)
ggside (1)
ggsignif (3)
ggspavis (79)
ggstance (1)
ggstatsplot (1)
ggsurvfir (1)
ggsurvfit (1)
ggtext (1)
ggthemes (4)
GGtools (6)
ggtree (17386)
ggtreeDendro (49)
ggtreeExtra (848)
ggvenn (1)
ggVennDiagram (1)
ggvis (0)
gh (55)
ghql (1)
gifski (1)
GIGSEA (52)
GillespieSSA (0)
Giotto (1)
girafe (73)
GISPA (42)
git2r (45)
gitcreds (10)
gitlabr (1)
GLAD (197)
GladiaTOX (37)
glasso (0)
glassoFast (1)
glca (1)
gld (1)
Glimma (1165)
gllvm (0)
glmGamPoi (2373)
GLMMadaptive (1)
glmmADMB (1)
glmmML (1)
glmmTMB (1)
glmnet (11)
glmnetUtils (2)
glmSparseNet (82)
glmx (1)
GlobalAncova (831)
GlobalOptions (1)
globals (10)
globals, (1)
globalSeq (55)
globaltest (1585)
GloScope (2)
glpgStyle (1)
glpgTesteR (1)
glpkAPI (1)
glue (15)
gmailr (1)
gmapR (70)
gMCP (1)
GmicR (50)
Gmisc (1)
gmm (1)
gmnl (1)
gmodels (1)
gmoviz (39)
gmp (8)
GMRP (37)
GNET2 (42)
gnm (1)
gnomAD (1)
GNOSIS (2)
GO.db (13)
goCluster (1)
GOexpress (85)
goftest (1)
GOfuncR (224)
GOFunction (3)
golem (2)
golubEsets (1)
gomms (0)
gongs (1)
googleAuthR (1)
googleCloudStorageR (1)
googledrive (56)
GoogleGenomics (2)
googlesheets4 (59)
googleVis (1)
GOplot (0)
GOpro (53)
goProfiles (70)
goprofiles (0)
GOSemSim (14013)
gosemsim (0)
goseq (1159)
goshawk (1)
GOSim (121)
goSorensen (32)
goSTAG (45)
GOstats (1611)
gostats (1)
GOsummaries (56)
GOTHiC (60)
goTools (50)
gotools (0)
gower (8)
GPA (52)
GPArotation (42)
gpart (12)
GPfit (1)
gplots (3)
gpls (106)
gprege (5)
gprofiler2 (0)
gpuMagic (40)
gQTLBase (4)
gQTLstats (5)
gRain (1)
gramm4R (2)
GRaNIE (71)
granny (1)
granulator (129)
graper (55)
grapg (1)
graph (17236)
GraphAlignment (59)
GraphAT (38)
graphat (0)
graphics (0)
graphite (2544)
graphlayouts (9)
GraphPAC (41)
graphql (1)
gRbase (1)
grDevices (1)
Greg (1)
GRENITS (54)
GreyListChIP (855)
grf (1)
grid (0)
gridBase (1)
gridExtra (1)
gridGraphics (1)
gridpattern (1)
gridSVG (1)
gridtext (1)
GRmetrics (72)
groHMM (54)
groupdata2 (1)
grpreg (1)
grr (1)
GRridge (28)
GSA (0)
gsalib (0)
GSALightning (57)
GSAR (100)
gsbDesign (1)
GSCA (44)
gscounts (1)
gscreend (43)
gsDesign (1)
GSEABase (7764)
gseabase (0)
GSEABenchmarkeR (60)
GSEAlm (60)
GSEAmining (64)
gsean (44)
GSgalgoR (50)
gsignal (1)
gsl (2)
gsmoothr (4)
gson (3)
gsrc (1)
GSReg (41)
GSRI (40)
gss (1)
gstat (1)
gsubfn (1)
GSVA (4862)
GSVAdata (1)
gsw (0)
gt (2)
gtable (97)
gto (1)
gtools (12)
gtrellis (98)
gtsummary (3)
gtx (0)
gubraqsar (1)
GUIDEseq (50)
Guitar (119)
GUniFrac (1)
gupio (1)
gUtils (0)
GUTS (0)
Gviz (3446)
GWAS.BAYES (50)
gwascat (449)
GWASExactHW (4)
gwasrapidd (1)
GWASTools (589)
gwasurvivr (73)
GWENA (109)
gWidgets (0)
gWidgets2tcltk (1)
gWidgetstcltk (0)

H

h2o (1)
h5vc (55)
HAC (1)
hal9001 (1)
HandTill2001 (1)
hapFabia (39)
HaploSim (1)
hardhat (48)
HardyWeinberg (1)
Harman (136)
HarmonizR (2)
harmony (2)
Harshlight (40)
harshlight (0)
hash (1)
haven (43)
hca (55)
HCABrowser (2)
HCAExplorer (2)
HCAMatrixBrowser (2)
HCsnip (1)
HDCytoData (1)
HDF5Array (10257)
hdf5r (1)
hdi (1)
HDInterval (8)
hdm (0)
HDO.db (4)
hdrcde (4)
HDTD (53)
heatmap.plus (0)
heatmap3 (0)
heatmaply (8)
heatmaps (243)
Heatplus (336)
heemod (1)
HelloRanges (80)
HELP (40)
helperMut (0)
HEM (38)
heplots (1)
here (1)
hermes (82)
HERON (2)
Herper (151)
hexbin (10)
hexSticker (1)
hexView (1)
HGC (58)
hgu133a.db (1)
hgu133plus2.db (5)
hgu219.db (1)
hgu95a.db (1)
hgu95av2.db (1)
hgug4112a.db (0)
hiAnnotator (61)
HIBAG (118)
HiCBricks (82)
hicbricks (0)
HiCcompare (188)
HiCDCPlus (64)
HiCDOC (45)
HiCExperiment (46)
HiClimR (1)
HiContacts (75)
HiCool (29)
hicrep (8)
hicVennDiagram (3)
hierfstat (1)
hierGWAS (56)
hierinf (47)
highcharter (1)
highlight (1)
highr (64)
highs (1)
HilbertCurve (75)
HilbertVis (143)
HilbertVisGUI (25)
HiLDA (38)
hipathia (61)
HIPPO (37)
hiReadsProcessor (44)
HIREewas (52)
HiTC (121)
hmdbQuery (66)
Hmisc (12)
HMMcopy (277)
hms (99)
Homo.sapiens (4)
hoodscanR (2)
Hoover (1)
hopach (202)
HPAanalyze (117)
hpar (228)
HPAStainR (40)
HPiP (49)
hrbrthemes (1)
HSAUR2 (1)
HSAUR3 (1)
hsm (1)
HSMMSingleCell (1)
htmlTable (5)
htmltools (176)
htmlwidgets (149)
HTqPCR (127)
HTSanalyzeR (4)
HTSeqGenie (32)
htSeqTools (5)
htseqtools (0)
HTSFilter (175)
htslib (1)
httpcode (1)
httpgd (1)
httptest (1)
httpuv (80)
httr (157)
httr2 (45)
HubPub (97)
huge (1)
HumanTranscriptomeCompendium (45)
hummingbird (38)
hunspell (2)
huxtable (1)
hwriter (2)
HWxtest (0)
HybridMTest (72)
hypeR (77)
hyperdraw (53)
hypergeo (1)
hypergraph (71)
hyperSpec (1)

I

IAPWS95 (1)
iASeq (50)
iasva (37)
iBBiG (89)
ibh (56)
iBMQ (29)
ica (2)
iCARE (85)
icenReg (1)
Icens (305)
icetea (36)
iCheck (35)
iChip (36)
ichorCNA (0)
iClusterPlus (299)
iCNV (39)
iCOBRA (145)
ICS (1)
ICSOutlier (1)
ideal (98)
ideogram (0)
IdeoViz (57)
idiogram (42)
IdMappingAnalysis (2)
IdMappingRetrieval (2)
IDPmisc (1)
idpr (54)
idr (0)
idr2d (40)
ids (1)
ieugwasr (0)
IFAA (31)
iFlow (2)
iGasso (1)
iGC (52)
IgGeneUsage (39)
igraph (43)
igraphdata (1)
igvR (97)
igvShiny (1)
iheatmapr (3)
IHW (600)
Illumina450ProbeVariants.db (0)
IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19 (5)
IlluminaHumanMethylation450kmanifest (4)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b2.hg19 (4)
IlluminaHumanMethylationEPICanno.ilm10b4.hg19 (4)
IlluminaHumanMethylationEPICmanifest (4)
illuminaio (2587)
ILoReg (38)
imageHTS (24)
imager (1)
imagerExtra (0)
IMAS (41)
imbalance (1)
imcRtools (138)
Imetagene (2)
iml (0)
IMMAN (43)
ImmuneSpaceR (49)
immunoClust (40)
immunotation (47)
IMPCdata (49)
import (1)
ImpulseDE (2)
ImpulseDE2 (7)
impute (9802)
imputeTS (1)
IncDTW (1)
INDEED (49)
ineq (0)
iNETgrate (12)
infer (8)
infercnv (1013)
inferCNV (1)
infinityFlow (47)
influenceR (3)
Informeasure (46)
infotheo (1)
ini (1)
InkblotAnalytics (19)
INLA (1)
inline (1)
inlinedocs (1)
InPAS (40)
INPower (54)
insight (3)
inSilicoDb (6)
inSilicoMerging (8)
insilicomerging (0)
INSPEcT (49)
INTACT (22)
InTAD (39)
intamap (0)
intansv (47)
interacCircos (67)
InteractionSet (1499)
InteractiveComplexHeatmap (281)
interactiveDisplay (76)
interactiveDisplayBase (8800)
InterCellar (68)
IntEREst (44)
intergraph (1)
InterMineR (52)
interp (2)
interpretR (0)
interval (1)
intervals (2)
IntOMICS (23)
IntramiRExploreR (39)
inum (1)
inveRsion (5)
inversion (0)
invgamma (1)
IONiseR (54)
iontree (2)
iPAC (46)
ipaddress (1)
iPath (38)
ipcwswitch (1)
ipdDb (40)
IPDfromKM (1)
ipmisc (0)
IPO (120)
IPPD (4)
ipred (47)
irace (0)
IRanges (46337)
iranges (1)
IRdisplay (1)
IRISFGM (34)
IrisSpatialFeatures (1)
IRkernel (1)
irlba (11)
irr (1)
ISAnalytics (43)
iSEE (327)
iSEEde (3)
iSEEhex (78)
iSEEhub (33)
iSEEindex (6)
iSEEpathways (3)
iSEEu (83)
iSeq (51)
ISLET (37)
ISLR (1)
iSNetwork (2)
Iso (1)
isoband (33)
isobar (68)
IsoBayes (1)
ISOcodes (1)
IsoCorrectoR (63)
IsoCorrectoRGUI (42)
IsoformSwitchAnalyzeR (240)
IsoGeneGUI (4)
ISoLDE (53)
isomiRs (52)
iSPlot (1)
isva (4)
ISwR (1)
ITALICS (43)
iterativeBMA (40)
iterativebma (0)
iterativeBMAsurv (48)
iterativebmasurv (0)
iterators (6)
iterClust (43)
iteremoval (3)
itertools (1)
itsadug (1)
IVAS (49)
ivpack (0)
ivprobit (1)
ivreg (1)
ivygapSE (37)
IWTomics (37)

J

JADE (1)
jagsUI (1)
janeaustenr (1)
janitor (2)
JASPAR2016 (1)
JASPAR2018 (1)
JASPAR2020 (4)
JavaGD (1)
JBTools (0)
jcolors (1)
JGR (1)
jiebaR (0)
jiebaRD (0)
JM (1)
JMbayes (1)
jmosaics (2)
jnjtemplates (1)
joda (3)
joineRML (1)
jomo (1)
jose (1)
jpeg (5)
jqr (1)
jquerylib (1)
js (1)
jsonify (1)
jsonlite (157)
jsTreeR (1)
jtools (1)
juicyjuice (1)
JuliaCall (0)
JunctionSeq (10)

K

kableExtra (1)
kangar00 (1)
karyoploteR (815)
KaryoploteR (0)
katdetectr (43)
katex (1)
KBoost (51)
KCsmart (40)
kebabs (98)
kedd (0)
KEGG.db (2)
KEGGgraph (5198)
kegggraph (1)
KEGGlincs (47)
keggorth (2)
keggorthology (71)
KEGGprofile (12)
KEGGREST (32466)
KEGGSOAP (2)
keggsvg (0)
Kendall (1)
keras (1)
KernelKnn (1)
kernlab (2)
KernSmooth (18)
keyring (1)
KFAS (1)
khroma (1)
kimod (2)
KinSwingR (41)
kissDE (35)
kit (1)
kknn (1)
klaR (1)
km.ci (1)
kmed (1)
kmknn (0)
kml (1)
kml3d (1)
KMsurv (1)
knitr (129)
knitrdata (1)
knockoff (1)
KnowSeq (43)
KODAMA (0)
kohonen (1)
kpmt (0)
kriging (1)
ks (1)
kSamples (1)
ktplots (1)

L

labdsv (1)
labeling (26)
labelled (2)
LACE (42)
laeken (1)
Lahman (1)
lambda.r (1)
lambdr (1)
LambertW (1)
lamW (1)
landscapemetrics (1)
languageserver (1)
LaplacesDemon (1)
lapmix (35)
lars (1)
lasso2 (1)
later (129)
latex2exp (1)
lattice (33)
latticeExtra (5)
lava (9)
lavaan (49)
lavaSearch2 (1)
lazy (0)
lazyeval (32)
LBE (257)
lbfgs (1)
lbfgsb3c (1)
lcopula (1)
lda (0)
ldap (0)
ldblock (50)
LDheatmap (1)
LDlinkR (1)
LEA (465)
leafcutter (0)
leafem (1)
leaflet (2)
leaflet.minicharts (1)
leaflet.providers (1)
leafpop (1)
leaps (1)
LearnBayes (1)
learnr (2)
LedPred (45)
lefser (398)
leiden (8)
leidenAlg (1)
leidenbase (7)
lemon (1)
lemur (1)
les (56)
levi (46)
lfa (295)
lfda (1)
lfe (1)
lgr (1)
lhs (7)
liana (1)
libcoin (1)
libgeos (1)
LiblineaR (7)
lifecycle (13)
lightgbm (1)
limma (31334)
limmaGUI (50)
limmia (1)
limSolve (1)
LINC (2)
LineagePulse (40)
lineagespot (32)
LinkHD (37)
Linnorm (134)
linprog (1)
LinTInd (39)
lintr (14)
lionessR (45)
lipidr (116)
LiquidAssociation (40)
liquidSVM (0)
lisaClust (109)
listenv (10)
listviewer (1)
littler (1)
lixoftConnectors (0)
lixoftConnectors.1 (0)
lixoftConnectors.2 (0)
lle (0)
lm.beta (1)
lmdme (41)
lme4 (72)
lmerTest (1)
LMGene (4)
lmodel2 (1)
lmom (2)
lmomco (1)
Lmoments (0)
lmtest (3)
LOBSTAHS (46)
lobstr (2)
locfdr (0)
locfit (29)
loci2path (35)
log4r (1)
logcondens (1)
logger (1)
logging (1)
logicFS (81)
LogicReg (1)
logistf (4)
logitnorm (1)
logitr (1)
logitT (38)
logitt (0)
Logolas (3)
logolas (1)
logr (1)
logspline (1)
lokern (1)
lol (2)
LOLA (174)
longitudinal (0)
longitudinalData (1)
longmemo (0)
loo (5)
LoomExperiment (467)
lotri (1)
LowMACA (19)
LowRankQP (1)
LPE (62)
LPEadj (37)
lpNet (47)
lpSolve (7)
lpSolveAPI (1)
lpsymphony (1223)
lqa (0)
lqmm (1)
LRBaseDbi (46)
LRcell (46)
lsa (6)
LSAF (1)
lsei (1)
lsmeans (1)
lubridate (22)
lumi (1040)
Luminescence (1)
lute (0)
lvec (1)
LVSmiRNA (3)
lwgeom (1)
LymphoSeq (50)

M

m03modeldevelopment (1)
M3C (865)
M3D (3)
M3Drop (446)
m6Aboost (34)
maanova (31)
Maaslin2 (695)
maboost (1)
Macarron (33)
macat (45)
maCorrPlot (50)
MACPET (4)
MACSQuantifyR (46)
MACSr (84)
maDB (2)
madb (0)
made4 (199)
madness (1)
MADSEQ (35)
maftools (2464)
MAGAR (47)
MAGeCKFlute (316)
magic (1)
magick (6)
magpie (20)
magrene (35)
magrittr (26)
MAI (38)
maic (1)
maicChecks (1)
maigesPack (43)
mailR (1)
MAIT (49)
makecdfenv (100)
makePlatformDesign (2)
maketools (1)
MALDIquant (2)
manipulate (1)
manipulateWidget (1)
MANOR (40)
manta (4)
MantelCorr (46)
mantelcorr (0)
maotai (1)
mapbayr (1)
mapdata (1)
mAPKL (21)
mapplots (1)
mapproj (1)
maPredictDSC (38)
maps (2)
mapscape (48)
maptools (12)
maptree (1)
mapview (1)
marginaleffects (1)
margins (1)
mariner (25)
Markdown (0)
markdown (79)
marqLevAlg (1)
marr (34)
marray (1646)
martini (43)
maser (98)
maSigPro (225)
maskBAD (38)
MASS (122)
MassArray (55)
massarray (0)
massiR (40)
MassSpecWavelet (1628)
MAST (1844)
mastR (22)
matchBox (49)
Matching (1)
MatchIt (1)
matchprobes (2)
MatchThem (0)
mathjaxr (3)
matlib (1)
Matrix (132)
Matrix.utils (1)
matrixcalc (1)
MatrixEQTL (1)
MatrixGenerics (35291)
MatrixModels (31)
MatrixQCvis (58)
MatrixRider (37)
matrixStats (51)
matrixTests (1)
matter (134)
MaxContrastProjection (2)
maxLik (1)
maxstat (1)
MBA (3)
MBAmethyl (47)
MBASED (47)
MBCB (39)
MBECS (43)
mbend (1)
mbkmeans (391)
mbOmic (31)
mboost (1)
mBPCR (43)
MBQN (38)
mbQTL (19)
MBttest (47)
mc2d (1)
mcaGUI (3)
MCbiclust (38)
mclogit (1)
mclust (2)
mclustcomp (1)
mcmc (1)
MCMCglmm (1)
MCMCpack (1)
MCPcounter (1)
mcr (0)
MCRestimate (3)
mCSEA (79)
mda (1)
mdgsa (6)
mdp (57)
mdqc (61)
MDTS (42)
MEAL (66)
MeasurementError.cor (49)
measurements (1)
measures (1)
MEAT (38)
MEB (33)
medflex (0)
mediation (1)
MEDIPS (93)
MEDME (40)
megadepth (111)
MEIGOR (54)
Melissa (38)
memes (174)
memisc (1)
memoise (14)
MEMSS (1)
memuse (1)
merDeriv (1)
MergeMaid (5)
mergemaid (0)
Mergeomics (62)
merTools (1)
MeSHDbi (176)
meshes (124)
meshr (87)
MeSHSim (1)
MesKit (56)
MESS (0)
messina (52)
meta (1)
metaArray (3)
metaarray (0)
Metab (39)
metabaser (1)
metabCombiner (38)
metabinR (45)
metaBLUE (1)
metaBMA (1)
MetaboAnalystR (0)
MetaboAnnotation (307)
MetaboCoreUtils (452)
metabolomics (1)
metabolomicsWorkbenchR (56)
metabomxtr (40)
MetaboReport (0)
MetaboSignal (87)
metaCCA (169)
metacore (1)
MetaCyto (48)
metadat (1)
metafor (1)
metagene (47)
metagene2 (56)
metagenomeFeatures (2)
metagenomeSeq (1287)
MetaGxOvarian (1)
metahdep (53)
metaMA (5)
metaMS (87)
MetaNeighbor (74)
metap (6)
MetaPhOR (34)
metaplot (1)
metaplus (1)
metapod (3798)
metapone (52)
metaR (0)
metaSeq (51)
metaseqR (5)
metaseqR2 (33)
MetaSKAT (0)
metatools (1)
MetaUtility (1)
metavizr (14)
MetaVolcanoR (70)
metaX (2)
MetCirc (43)
MethCP (17)
methimpute (51)
methInheritSim (44)
methods (0)
MethPed (38)
MethReg (58)
methrix (63)
MethTargetedNGS (39)
methVisual (3)
methyAnalysis (9)
MethylAid (54)
methylCC (59)
methylclock (120)
methylclockData (1)
methylGSA (97)
methylInheritance (48)
methylKit (542)
MethylMix (97)
methylMnM (40)
methylPipe (56)
methylscaper (35)
MethylSeekR (126)
methylSig (53)
methylumi (1301)
methyvim (2)
MetID (41)
MetNet (42)
metR (1)
mets (1)
mev (1)
mfa (70)
mFilter (1)
Mfuzz (941)
mfuzz (0)
mfx (1)
mg14 (0)
mgcv (102)
MGFM (38)
MGFR (38)
mgm (1)
mgsa (105)
mhurdle (1)
mi (0)
mia (1151)
miaSim (77)
miaViz (189)
mice (9)
miceadds (1)
MiChip (35)
microbenchmark (1)
microbiome (1530)
microbiomeDASim (39)
microbiomeExplorer (57)
microbiomeMarker (309)
MicrobiomeProfiler (78)
MicrobiotaProcess (401)
micromap (1)
microRNA (131)
microseq (1)
Microsoft365R (1)
microSTASIS (23)
MICSQTL (6)
midasHLA (51)
MIGSA (19)
MIIVsem (0)
miloR (205)
mimager (38)
mime (41)
MIMOSA (39)
mimosa (1)
mina (43)
MineICA (51)
minerva (0)
minet (540)
minfi (2018)
MinimumDistance (39)
miniUI (1)
minpack.lm (1)
minqa (20)
MiPP (37)
miQC (102)
MIRA (59)
MiRaGE (41)
mirai (1)
miRBaseConverter (157)
miRcomp (38)
mirIntegrator (39)
miRLAB (41)
miRmine (33)
miRNAmeConverter (45)
miRNApath (61)
miRNAtap (103)
miRSM (34)
miRsponge (1)
miRspongeR (50)
Mirsynergy (2)
mirt (13)
mirTarRnaSeq (59)
misc3d (1)
miscTools (1)
missForest (1)
missMDA (1)
missMethyl (942)
missRanger (1)
missRows (41)
mistyR (86)
mitch (65)
mitml (1)
mitoClone2 (32)
mitoODE (2)
mitools (1)
mixOmics (2917)
mixsqp (11)
mixtools (1)
mlbench (5)
MLEcens (1)
mlegp (1)
mlflow (1)
MLInterfaces (232)
mlm4omics (1)
MLmetrics (1)
mlmm.gwas (1)
mlmRev (1)
mlogit (1)
MLP (66)
mlpack (1)
mlr (0)
mlr3 (1)
mlr3cluster (0)
mlr3data (1)
mlr3filters (0)
mlr3fselect (0)
mlr3hyperband (0)
mlr3learners (0)
mlr3measures (1)
mlr3misc (1)
mlr3pipelines (1)
mlr3proba (0)
mlr3tuning (1)
mlr3verse (0)
MLSeq (98)
mlt (1)
mltools (0)
MMAPPR2 (24)
MMDiff (2)
MMDiff2 (39)
mmgmos (1)
mmnet (1)
MmPalateMiRNA (2)
mmrm (1)
MMUPHin (80)
mnem (62)
mnormt (9)
MNP (1)
moanin (62)
MobilityTransformR (32)
mobster (0)
mockery (1)
mockr (1)
MODA (43)
ModCon (42)
modelbased (1)
modeldata (8)
modelenv (1)
ModelMetrics (1)
modelr (45)
modelsummary (1)
modeltests (1)
modeltools (1)
MODIStsp (0)
Modstrings (87)
modules (4)
MOFA (6)
MOFA2 (354)
MOGAMUN (40)
mogsa (122)
moleculaR (1)
MoleculeExperiment (26)
MOMA (50)
moments (1)
Momocs (1)
monaLisa (88)
mondate (1)
monocle (2711)
Moonlight2R (2)
MoonlightR (47)
MoPS (2)
morpheus (1)
Morpho (1)
mosaicCore (1)
mosaics (102)
mosbi (41)
MOSim (38)
Motif2Site (36)
motifbreakR (98)
motifcounter (47)
MotifDb (537)
motifmatchr (1076)
motifRG (4)
motifStack (595)
MotIV (26)
mouse4302.db (1)
MouseFM (35)
MPA (1)
mpath (0)
MPFE (46)
MplusAutomation (1)
mpn.scorecard (1)
mppR (1)
mpra (43)
MPRAnalyze (53)
MPV (1)
MQmetrics (46)
mQTL.NMR (1)
mratios (1)
mrgda (1)
mrggsave (1)
mrgmisc (1)
mrgsolve (1)
mrgvalidate (1)
mrgvalprep (1)
msa (1359)
MSA2dist (70)
MsBackendMassbank (56)
MsBackendMgf (444)
MsBackendMsp (102)
MsBackendRawFileReader (38)
MsBackendSql (21)
msbase (0)
mscalib (0)
MsCoreUtils (2916)
msdata (1)
MsDataHub (28)
MSEADbi (1)
MsExperiment (144)
MsFeatures (1364)
msgbsR (46)
MSGFgui (3)
MSGFplus (9)
msigdb (1)
msigdbr (1)
msImpute (56)
mslp (36)
msm (1)
msmsEDA (188)
msmsTests (179)
MSnbase (2822)
msnbase (0)
MSnID (157)
MSPrep (43)
msPurity (62)
msQC (0)
msqrob2 (93)
MsQuality (28)
MSstats (406)
MSstatsBig (2)
MSstatsConvert (372)
MSstatsLiP (42)
MSstatsLOBD (47)
MSstatsPTM (117)
MSstatsQC (37)
MSstatsQCgui (32)
MSstatsSampleSize (32)
MSstatsShiny (72)
MSstatsTMT (209)
MSstatsTMTPTM (1)
MSstatsTMTs (1)
mstate (1)
MSwM (1)
mtbls2 (0)
MTseeker (2)
MuData (38)
muhaz (1)
Mulcom (62)
mulcom (0)
multcomp (2)
multcompView (41)
multgee (1)
MultiAssayExperiment (3712)
MultiBaC (48)
multiClust (54)
multicool (1)
multicrispr (42)
multicross (1)
MultiDataSet (842)
multidplyr (1)
multiGSEA (92)
multiHiCcompare (110)
MultiMed (54)
multiMiR (215)
MultimodalExperiment (20)
multimode (1)
multinichenetr (1)
multinma (1)
multiOmicsViz (44)
multipanelfigure (1)
MultiRNAflow (2)
multiscan (38)
multiSight (33)
multiwayvcov (1)
multiWGCNA (5)
multtest (10936)
MuMIn (1)
mumosa (54)
MungeSumstats (556)
munsell (1)
muscat (292)
muscData (1)
muscle (219)
musicatk (52)
MutationalPatterns (311)
MutationTimeR (0)
mutoss (6)
mutSigExtractor (0)
mvabund (1)
MVCClass (56)
mvGST (1)
mvna (1)
mvnfast (1)
mvnormtest (1)
mvtnorm (30)
MWASTools (84)
mygene (338)
myphd (1)
myvariant (59)
mzID (2613)
mzR (2867)

N

n1qn1 (1)
N2R (0)
nabor (1)
NADA (4)
NADfinder (34)
naniar (1)
NanoMethViz (60)
nanonext (1)
NanoStringDiff (87)
NanoStringNCTools (280)
NanoStringQCPro (67)
nanostringr (1)
nanotatoR (44)
nanotime (1)
NanoTube (68)
narray (1)
NarrowPeaks (3)
nasapower (1)
nat.util (1)
nat.utils (1)
natserv (1)
naturalsort (1)
NBAMSeq (39)
NbClust (1)
nbpMatching (1)
NBSplice (18)
ncappc (1)
ncar (1)
ncbit (0)
ncdf4 (1)
ncdf4.1 (0)
ncdfFlow (1045)
ncGTW (32)
NCIgraph (45)
ncRNAtools (40)
ncvreg (1)
ndexr (61)
ndjson (0)
neaGUI (2)
nearBynding (34)
Nebulosa (795)
NeighborNet (30)
nem (8)
NEMO (0)
nempi (36)
NEONiso (1)
neonUtilities (0)
nephro (0)
nestedLogit (1)
nestedmodels (1)
NetActivity (39)
netbenchmark (3)
netbiov (46)
netboost (33)
netboxr (19)
NetCRG (0)
netDx (38)
nethet (40)
netmeta (1)
netOmics (40)
NetPathMiner (61)
netprioR (48)
netrankr (1)
netReg (2)
netresponse (48)
NetSAM (44)
netSmooth (51)
NetSwan (1)
network (1)
networkBMA (7)
networkD3 (1)
networkDynamic (0)
netZooR (44)
NeuCA (30)
neuralnet (1)
NeuralNetTools (1)
neuRosim (0)
NewWave (59)
nFactors (1)
NGScopy (1)
ngsReports (70)
NHANES (1)
nhanesA (1)
nimble (1)
nipals (1)
nipalsMCIA (3)
NISTunits (1)
NlcOptim (1)
nleqslv (1)
nlme (107)
nlmixr2 (1)
nlmixr2data (1)
nlmixr2est (1)
nlmixr2extra (1)
nlmixr2lib (1)
nlmixr2plot (1)
nlmixr2rpt (1)
nloptr (54)
NLP (0)
NMcalc (1)
NMdata (1)
NMF (6)
NMproject (0)
nmrec (1)
NMsim (1)
nnet (65)
NNLM (1)
nnls (1)
nnNorm (40)
nnSVG (62)
NoiseFiltersR (0)
NOISeq (526)
NonCompart (1)
nondetects (55)
nonmem2R (1)
nonmem2rx (1)
nonmemica (1)
nonnest2 (1)
nor1mix (1)
NoRCE (45)
norm (1)
normalize450K (36)
NormalizerDE (1)
NormalyzerDE (112)
NormqPCR (180)
normr (126)
nortest (1)
Nozzle.R1 (1)
np (0)
NPARC (45)
npde (1)
npGSEA (46)
nphRCT (1)
npsurv (1)
NTW (49)
nucleoSim (44)
nucleR (58)
nucler (0)
nuCpos (51)
nudge (2)
nullranges (69)
numbat (4)
numbers (1)
numDeriv (1)
NuPoP (64)
NxtIRFcore (35)
nycflights13 (1)

O

oaqc (1)
occugene (44)
OceanView (0)
OCplus (69)
octad (35)
odbc (9)
oddsratio (0)
ODER (27)
odseq (57)
odyproteomicsValidator (1)
officedown (1)
officer (9)
OGRE (39)
OGSA (2)
oligo (1492)
oligoClasses (1487)
OLIN (43)
OLINgui (37)
omada (26)
OmaDB (101)
omicade4 (94)
OmicCircos (171)
omiccircos (0)
omicplotR (44)
omicRexposome (37)
omicsbase (1)
OmicsLonDA (35)
OmicsMarkeR (2)
omicsmarker (0)
OMICsPCA (40)
omicsPrint (41)
omicsViewer (43)
Omixer (49)
OmnipathR (412)
ompBAM (67)
ompr (1)
ompr.roi (1)
Onassis (2)
onbrand (1)
OncoBayes2 (1)
oncomix (35)
oncoscanR (34)
OncoScore (40)
OncoSimulR (50)
oneChannelGUI (4)
onechannelgui (0)
oneSENSE (20)
onlineFDR (50)
ontoCAT (4)
ontologyIndex (12)
ontoProc (112)
ontoTools (2)
oompaBase (2)
oompaData (2)
opdisDownsampling (1)
openCyto (671)
OpenMx (1)
openPrimeR (90)
openPrimeRui (47)
openssl (177)
OpenStats (46)
openxlsx (17)
openxlsx2 (1)
OperaMate (1)
operator.tools (1)
oposSOM (55)
oppar (37)
oppti (34)
optextras (1)
optimalFlow (35)
optimParallel (1)
optimr (1)
optimx (9)
optmatch (1)
optparse (50)
optpart (1)
optweight (1)
OPWeight (38)
OrderedList (74)
ordinal (1)
ORFhunteR (40)
ORFik (157)
org.Ag.eg.db (1)
org.At.tair.db (1)
org.Bt.eg.db (1)
org.Ce.eg.db (1)
org.Cf.eg.db (1)
org.Dm.eg.db (1)
org.Dr.eg.db (1)
org.Gg.eg.db (0)
org.Hs.eg.db (13)
org.Hs.eg.db.html (1)
org.Mm.eg.db (9)
org.Mmu.eg.db (1)
org.Pt.eg.db (1)
org.Rn.eg.db (7)
org.Sc.sgd.db (1)
org.Ss.eg.db (1)
org.Xl.eg.db (1)
Organism.dplyr (351)
OrganismDbi (2861)
orientlib (1)
origami (1)
orthogene (232)
Orthology.eg.db (1)
orthopolynom (1)
orthos (4)
OSAT (57)
OSCA (5)
OSCA.advanced (20)
OSCA.basic (22)
OSCA.intro (121)
OSCA.multisample (17)
OSCA.workflows (34)
Oscope (56)
oskeyring (1)
osmdata (31)
osprey (1)
osqp (1)
OTUbase (38)
OutlierD (4)
OUTRIDER (147)
OutSplice (17)
overlapping (1)
OVESEG (36)

P

PAA (49)
PACKAGE (0)
packer (1)
packFinder (41)
packrat (26)
pacman (1)
padma (39)
PADOG (169)
padr (1)
pagedown (1)
pageRank (37)
pagoda2 (1)
PAIRADISE (73)
paircompviz (42)
PairedData (1)
pairedGSEA (15)
pairkat (32)
pairseqsim (1)
pairwiseComparisons (0)
pak (1)
paletteer (1)
Palimpsest (0)
palmerpenguins (1)
pals (1)
pammtools (1)
pamr (3)
PAN (0)
pan (1)
pandaR (92)
pander (2)
panelcn.mops (62)
panelr (1)
PAnnBuilder (2)
PanomiR (35)
panp (38)
PANR (39)
PanViz (44)
PanVizGenerator (4)
PAPi (4)
paradox (1)
parallel (0)
parallelly (63)
parallelMap (1)
param6 (0)
parameters (2)
ParamHelpers (0)
pareg (26)
parglms (36)
parody (59)
parsedate (1)
parsnip (8)
partCNV (6)
partitions (1)
party (1)
partykit (2)
PAST (38)
pastecs (0)
PASWR (1)
patchwork (19)
Path2PPI (58)
pathfindR.data (0)
pathifier (137)
pathlinkR (0)
PathNet (60)
PathoStat (50)
pathprint (2)
pathRender (37)
pathVar (43)
pathview (4032)
pathwayPCA (88)
PathwaySplice (2)
PatientGeneSets (1)
patrick (1)
paws (7)
paws.analytics (7)
paws.application.integration (8)
paws.common (10)
paws.compute (8)
paws.cost.management (7)
paws.customer.engagement (7)
paws.database (7)
paws.developer.tools (7)
paws.end.user.computing (7)
paws.machine.learning (7)
paws.management (7)
paws.networking (7)
paws.security.identity (7)
paws.storage (7)
paxtoolsr (84)
pbapply (25)
Pbase (2)
pbcmc (2)
pbdZMQ (1)
PBIR (1)
pbivnorm (1)
pbkrest (1)
pbkrtest (64)
pbmcapply (1)
pbmcref.SeuratData (0)
PBSmapping (1)
pcaExplorer (356)
pcaGoPromoter (5)
pcalg (1)
pcaMethods (4583)
PCAN (47)
pcaPP (8)
PCAtools (1036)
PCDimension (1)
pch (1)
PCICt (1)
pcot2 (4)
PCpheno (2)
pcse (1)
pctGCdata (0)
pcxn (44)
pd.atdschip.tiling (1)
pd.hg.u133.plus.2 (1)
pd.mouse430.2 (1)
PDATK (41)
pdfCluster (1)
pdftools (1)
pdInfoBuilder (93)
pdmclass (2)
pdp (1)
PeacoQC (131)
peakPantheR (44)
peakPick (0)
pec (1)
PECA (45)
peco (34)
pedigree (1)
pegas (1)
pegboard (1)
PEIP (1)
penalized (1)
pengls (32)
peperr (0)
PepsNMR (77)
pepStat (39)
Peptides (1)
pepXMLTab (57)
PERFect (49)
performance (2)
PerformanceAnalytics (1)
periodicDNA (40)
perm (6)
permimp (1)
permute (2)
perturbatr (2)
PFAM.db (8)
pfamAnalyzeR (86)
PFIM (1)
PFP (31)
PGA (4)
pga (0)
pgca (49)
pgirmess (1)
PGSEA (33)
pgUtils (2)
pgxRpi (0)
phangorn (2)
phantasus (79)
phantasusLite (1)
PharmacoGx (159)
pharmaRTF (1)
pharmaversesdtm (1)
pheatmap (1)
phemd (25)
phenoDist (2)
PhenoGeneRanker (46)
phenomis (39)
phenopath (77)
phenoTest (66)
PhenStat (40)
PheWAS (0)
philentropy (1)
philr (188)
PhIPData (49)
phonTools (0)
phosphonormalizer (44)
phosphoricons (4)
PhosR (85)
phyclust (1)
phylobase (1)
phylocanvas (1)
phylogram (1)
phylolm (1)
PhyloProfile (52)
phyloseq (4810)
phylosignal (1)
phylotools (1)
phyr (1)
phytools (2)
Pi (65)
piano (301)
pickgene (46)
PICS (68)
Pigengene (69)
pillar (137)
pim (0)
pimeta (1)
PING (41)
pingr (1)
pins (31)
pint (3)
pio (0)
pipeComp (38)
pipeFrame (108)
pipeR (1)
pixmap (1)
PK (1)
pkgbuild (70)
pkgcache (1)
pkgconfig (3)
pkgdepends (1)
pkgDepTools (27)
pkgdown (8)
pkgKitten (1)
pkgload (97)
pkgmaker (1)
pkgsearch (1)
PKI (1)
PKNCA (1)
PKPDmodels (1)
planet (135)
planttfhunter (22)
plasmut (2)
plateCore (3)
plethy (21)
plgem (56)
plier (106)
plm (1)
PloGO2 (52)
plogr (1)
plot3D (1)
plot3Drgl (0)
plotfunctions (1)
plotgardener (213)
plotGrouper (50)
plotly (41)
plotlyGeoAssets (1)
plotmm (1)
plotmo (1)
plotrix (2)
PLPE (39)
plrs (2)
pls (1)
plumber (1)
plw (2)
plyinteractions (2)
plyr (37)
plyranges (1028)
PMA (1)
pmartR (1)
PMCMRplus (1)
pmforest (1)
pmm (45)
pmml (1)
pmp (108)
pmparams (1)
pmplots (1)
pmtables (1)
pmxTools (1)
png (18)
PoDCall (46)
podkat (44)
pogos (42)
pointblank (1)
PoissonSeq (0)
poLCA (1)
polspline (1)
Polychrome (1)
polyclip (13)
polycor (1)
polyester (112)
Polyfit (2)
polynom (2)
PolynomF (1)
polysat (1)
POMA (65)
pool (1)
poolfstat (1)
poorman (1)
PopED (1)
poppr (1)
PossibilityCurves (1)
POST (2)
posterior (8)
PoTRA (10)
PowerExplorer (2)
poweRlaw (4)
powerTCR (353)
PowerTOST (1)
POWSC (39)
ppcor (1)
ppcseq (39)
PPInfer (69)
ppiStats (4)
pqsfinder (69)
prabclus (1)
pracma (8)
prada (11)
praise (1)
pram (36)
preAnomalyDetectionCredLife (1)
prebs (39)
PreciseSums (1)
preciseTAD (35)
PrecisionTrialDrawer (4)
precommit (0)
PREDA (69)
prediction (1)
predictionet (3)
predint (1)
PReMiuM (1)
preprocessCore (14004)
preprocesscore (1)
PreprocessCore (1)
PresenceAbsence (0)
preseqR (0)
presto (1)
prettycode (1)
prettydoc (1)
prettyunits (40)
primirTSS (42)
PrInCE (39)
princurve (1)
printr (1)
prioritylasso (0)
prismatic (1)
Prize (2)
proActiv (52)
proBAMr (40)
proBatch (64)
pROC (29)
PROcess (79)
processCore (1)
processx (167)
procoil (40)
ProCoNA (2)
proDA (155)
prodlim (50)
productplots (1)
proffer (1)
proFIA (18)
profile (0)
profileModel (1)
profileplyr (194)
profileScoreDist (34)
profmem (1)
profvis (24)
progeny (328)
progress (1)
progressr (21)
PROJ (1)
proj (1)
proj4 (7)
ProjecTILs (1)
projectR (58)
projpred (1)
pRoloc (195)
pRolocdata (8)
pRolocGUI (69)
PROMISE (41)
promises (86)
prompt (1)
PROPER (72)
propr (1)
PROPS (34)
PROreg (1)
Prostar (63)
prostar (0)
prot2D (2)
proteasy (36)
proteinProfiles (45)
ProteoDisco (38)
ProteomicsAnnotationHubData (2)
ProteoMM (61)
proteoQC (2)
protGear (37)
ProtGenerics (10206)
proto (1)
protolite (1)
protr (5)
proxy (2)
proxyC (0)
PRROC (4)
pryr (7)
ps (160)
PSCBS (5)
pscl (1)
PSEA (41)
psichomics (54)
PSICQUIC (9)
PSMatch (101)
PsNR (1)
pspline (1)
psych (47)
psychometric (0)
psychotools (1)
psychotree (1)
psychTools (1)
psygenet2r (43)
ptairMS (34)
Publish (1)
PubScore (3)
PullReadAnalysisData (1)
pulsar (0)
pulsedSilac (4)
puma (77)
PureCN (134)
purr (0)
purrr (101)
purrrlyr (1)
pvac (37)
pvca (210)
pvclust (1)
Pviz (53)
PWMEnrich (81)
pwOmics (40)
pwr (1)
pwrEWAS (44)
pxr (0)
pyinit (1)
pzfx (1)

Q

qap (5)
qcc (1)
qckitfastq (54)
qcmetrics (43)
qcNvs (0)
qdapRegex (1)
qdapTools (1)
QDNAseq (304)
QDNAseq.hg19 (1)
QDNAseq.mm10 (1)
QFeatures (633)
qgam (1)
qgraph (1)
qlcMatrix (4)
qmtools (37)
qpcR (1)
qpcrNorm (41)
qpdf (1)
qpgraph (114)
qPLEXanalyzer (46)
qqconf (4)
qqman (1)
qqplotr (1)
qreport (1)
qrng (1)
qrnn (1)
qrqc (49)
qs (2)
QSARdata (1)
qsea (55)
qsmooth (59)
QSutils (42)
qsvaR (36)
qtbase (0)
qtl (1)
qtl2 (1)
QTLExperiment (2)
Qtlizer (36)
qtpaint (0)
quadprog (1)
QUALIFIER (2)
qualifier (0)
qualpalr (1)
quantable (1)
quantiseqr (385)
quantmod (6)
quantreg (59)
quantro (259)
quantsmooth (640)
quarto (3)
QuartPAC (34)
QuasR (299)
QuaternaryProd (70)
QUBIC (114)
questionr (1)
QuickJSR (1)
qusage (339)
qvalue (15091)
qvcalc (1)

R

R.cache (1)
R.devices (6)
R.filesets (6)
R.huge (4)
R.matlab (0)
R.methodsS3 (3)
R.oo (3)
R.rsp (1)
R.utils (18)
r2d2 (1)
r2d3 (1)
R2HTML (1)
R2jags (1)
R2OpenBUGS (1)
r2rtf (1)
R2wd (1)
R2WinBUGS (1)
R3CPET (37)
r3Cseq (73)
R453Plus1Toolbox (43)
R4RNA (539)
R6 (58)
rAccess (1)
radarchart (1)
radiator (1)
RadioGx (40)
raer (2)
ragg (17)
RaggedExperiment (833)
RAIDS (2)
rain (75)
rainbow (5)
rama (32)
rAmCharts (1)
RamiGO (5)
ramigo (0)
ramr (37)
ramwas (65)
randomcoloR (4)
RandomFields (0)
RandomFieldsUtils (0)
randomForest (1)
randomForestSRC (1)
randomizr (1)
randomNames (1)
RandomWalkRestartMH (85)
randPack (40)
randRotation (45)
randtoolbox (1)
ranger (1)
RankAggreg (1)
RankProd (223)
RANN (1)
RApiDatetime (1)
rapidjsonr (1)
rapidoc (1)
RApiSerialize (1)
rappdirs (3)
rapportools (1)
RAREsim (43)
RareVariantVis (39)
Rariant (2)
rARPACK (4)
Rarr (61)
raster (46)
ratelimitr (1)
RAthena (7)
rawrr (174)
RbcBook1 (85)
Rbec (35)
rbenchmark (1)
RBesT (1)
RBGL (8945)
rbgl (0)
rbibutils (2)
rbioapi (2)
RBioFormats (39)
RBioinf (47)
rbioinf (0)
rBiopaxParser (145)
rBLAST (1)
RBM (44)
rbmi (1)
Rbowtie (412)
Rbowtie2 (282)
rbsurv (47)
Rbwa (72)
Rcade (29)
rcartocolor (1)
RCAS (53)
RCASPAR (46)
rcdk (7)
RCdk (1)
rcdklibs (7)
rcellminer (55)
rCGH (61)
Rcgmin (1)
Rchemcpp (2)
Rchoice (1)
RchyOptimyx (3)
RCircos (0)
RcisTarget (946)
RClickhouse (1)
rclipboard (0)
RCM (40)
rcmdcheck (46)
Rcollectl (14)
RColorBrewer (9)
rcompanion (1)
RConferoMapping (0)
rcorpora (1)
Rcpi (105)
Rcpp (122)
RcppAnnoy (21)
RcppArmadillo (90)
RcppCCTZ (1)
RcppClassic (1)
RcppDate (1)
RcppDE (1)
RcppDist (1)
RcppEigen (12)
RcppGSL (1)
RcppHNSW (10)
RcppML (3)
RcppNumerical (1)
RcppParallel (11)
RcppProgress (1)
RcppRoll (1)
RcppSimdJson (1)
RcppSpdlog (1)
RcppThread (1)
RcppTOML (10)
RcppZiggurat (5)
Rcsdp (1)
RCSL (48)
RCurl (30)
RCurl.back (0)
Rcwl (42)
RcwlPipelines (40)
RCX (69)
RCy3 (694)
RCyjs (48)
RCytoscape (6)
Rd2roxygen (0)
rda (0)
RDAVIDWebService (31)
Rdbi (2)
RdbiPgSQL (1)
rdd (1)
rDGIdb (76)
Rdimtools (1)
Rdisop (427)
Rdpack (2)
RDRToolbox (96)
Rdsdp (1)
reactable (2)
reactlog (1)
reactome.db (4)
ReactomeContentService4R (77)
ReactomeGraph4R (35)
ReactomeGSA (206)
ReactomePA (2035)
reactR (2)
readat (4)
readbitmap (1)
readODS (1)
ReadqPCR (187)
readr (54)
readstata13 (1)
readxl (44)
reb (3)
REBayes (1)
REBET (37)
rebook (215)
receptLoss (31)
recipes (44)
reclin (1)
recommenderlab (7)
reconsi (33)
recosystem (12)
recount (381)
recount3 (314)
recountmethylation (42)
recoup (39)
reda (1)
REddyProc (0)
RedeR (236)
RedisParam (34)
redoc (1)
REDseq (62)
redux (1)
RefManageR (1)
RefNet (2)
RefPlus (47)
RegEnrich (54)
regionalpcs (1)
RegionalST (2)
regioneR (1859)
regioneReloaded (32)
regionReport (92)
registry (1)
RegParallel (1)
regsplice (32)
regutools (42)
relaimpo (1)
relations (1)
reldist (5)
relimp (1)
remaCor (3)
rematch (16)
rematch2 (1)
remotes (68)
REMP (50)
rentrez (1)
renv (106)
Repitools (302)
report (1)
reporter (1)
reporting (0)
ReportingTools (673)
reposTools (1)
repr (1)
reprex (10)
repurrrsive (1)
RepViz (42)
ReQON (34)
reReg (1)
resample (0)
reshape (2)
reshape2 (7)
ResidualMatrix (2994)
RESOLVE (39)
Resourcerer (2)
restfulr (5)
restfulSE (66)
reticulate (23)
retrofit (20)
ReUseData (12)
revealgenomics (1)
RevGadgets (1)
review (1)
rex (47)
rexposome (67)
rfaRm (35)
Rfast (8)
Rfastp (127)
rfcdmin (1)
Rfit (1)
rflowcyt (2)
RFOC (3)
rfPred (42)
rGADEM (311)
RGalaxy (4)
rgbif (1)
RGCCA (1)
rgdal (2)
rGenomeTracks (35)
rgenoud (1)
rgeos (8)
rgexf (1)
Rgin (4)
rgl (2)
Rglpk (2)
RGMQL (28)
RgnTX (29)
RgoogleMaps (1)
rgoslin (59)
RGraph2js (38)
Rgraphviz (9217)
rgraphviz (1)
rGREAT (615)
RGSEA (58)
rgsepd (36)
rhandsontable (2)
rhdf5 (17440)
rhdf5client (65)
rhdf5filters (17074)
Rhdf5lib (19312)
rhino (4)
Rhisat2 (160)
RhpcBLASctl (1)
Rhtslib (20444)
rhub (1)
rHVDM (2)
RiboCrypt (33)
RiboDiPA (41)
RiboProfiling (59)
ribor (37)
riboSeq (0)
riboSeqR (30)
ribosomeProfilingQC (55)
rice (1)
RIdeogram (1)
ridigbio (0)
rifi (27)
rifiComparative (16)
RImmPort (48)
Ringo (332)
RInside (0)
Rintact (1)
rintrojs (1)
rio (5)
RIPAT (33)
RIPSeeker (16)
Risa (45)
riskmetric (1)
riskRegression (1)
RITAN (44)
ritis (1)
RItools (1)
RIVER (34)
rj (1)
rj.gd (1)
rjags (1)
rJava (1)
RJDBC (1)
RJMCMCNucleosomes (35)
rjson (15)
RJSONIO (7)
Rlab (1)
rlang (126)
RLassoCox (56)
rle (0)
rlecuyer (1)
rlemon (1)
rlist (1)
RLMM (51)
RLRsim (1)
RLSeq (35)
rly (0)
RMAGEML (1)
Rmagic (1)
Rmagpie (35)
RMAPPER (2)
RMariaDB (1)
rmarkdown (139)
RMassBank (74)
rMAT (4)
rmatio (1)
rmcorr (1)
rmdformats (1)
rmelting (66)
rmeta (1)
rminer (1)
rmio (1)
RmiR (4)
rmir (0)
Rmisc (1)
Rmmquant (37)
Rmpfr (8)
Rmpi (1)
rms (1)
rmsb (1)
rmspc (42)
RMTstat (1)
rmutil (1)
rMVP (1)
RMySQL (2)
RNAAgeCalc (60)
RNAdecay (43)
rnaEditr (34)
RNAi (1)
RNAinteract (45)
RNAither (3)
rnaither (0)
RNAmodR (56)
RNAmodR.AlkAnilineSeq (39)
RNAmodR.ML (32)
RNAmodR.RiboMethSeq (35)
RNAprobR (2)
RNAsense (33)
rnaseqcomp (60)
RNAseqCovarImpute (1)
RnaSeqGeneEdgeRQL (1)
rnaSeqMap (3)
RNASeqPower (123)
RNASeqR (19)
RnaSeqSampleSize (81)
rnaturalearth (1)
RnBeads (204)
RnBeads.hg19 (2)
RnBeads.hg38 (2)
RnBeads.mm10 (2)
RnBeads.mm9 (2)
RnBeads.rn5 (2)
rncl (1)
RNeXML (1)
rngtools (1)
rngWELL (1)
Rnits (25)
roar (42)
roastgsa (2)
robfilter (1)
RobinCar (1)
RobStatTM (1)
robumeta (1)
robust (3)
robustbase (7)
robustlmm (1)
ROC (1011)
ROCpAI (35)
ROCR (1)
RODBC (1)
ROI (1)
ROI.plugin.lpsolve (1)
RolDE (36)
Roleswitch (3)
Rolexa (2)
roll (1)
rols (275)
roma (1)
ROntoTools (110)
Rook (1)
rootSolve (2)
ropls (839)
roptim (1)
ROracle (1)
ROSeq (35)
rosettR (1)
rotl (1)
ROTS (161)
round (1)
roxygen (1)
roxygen2 (55)
RPA (38)
rpact (1)
rpart (52)
rpart.plot (1)
RPEGLMEN (1)
RPEIF (1)
RPESE (1)
rpf (1)
RPMG (3)
RPostgres (8)
RPostgreSQL (1)
rprimer (55)
rprintf (1)
rprojroot (61)
RProtoBufLib (2179)
rpsftm (1)
RpsiXML (8)
RPtests (1)
RPushbullet (1)
rpx (235)
Rqc (227)
rqt (38)
rqubic (59)
rr2 (1)
rrapply (1)
rrBLUP (1)
rrcov (7)
rRDP (45)
Rredland (2)
rredlist (1)
RRHO (97)
RRPP (1)
rrvgo (309)
rsample (10)
Rsamtools (20235)
rsamtools (0)
rsbml (87)
rsconnect (58)
rScudo (39)
RSEIS (3)
RSelenium (1)
rsemmed (46)
RSeqAn (69)
Rserve (0)
rSFFreader (2)
RSiena (1)
rslurm (1)
rsm (1)
Rsmlx (1)
Rsmlx.1 (0)
Rsmlx.2 (0)
RSNNS (0)
RSNPper (1)
rsnps (1)
Rsolnp (3)
RSpectra (5)
RSQLite (90)
Rssa (0)
RsSimulx (1)
RsSimulx.1 (0)
rstan (8)
rstanarm (1)
rstantools (6)
rstatix (11)
rstpm2 (1)
rstudio (0)
rstudioapi (105)
Rsubread (2208)
rsvd (7)
rsvg (1)
RSVSim (45)
rSWeeP (46)
Rsymphony (1)
rtables (1)
rTANDEM (6)
RTCA (41)
RTCGA (504)
RTCGAToolbox (573)
rtdists (1)
rtf (1)
rticles (1)
rtkore (1)
RTN (114)
RTNduals (51)
RTNsurvival (52)
RTools4TB (2)
RTopper (38)
Rtpca (35)
rtracklayer (18490)
Rtreemix (40)
rTRM (49)
rTRMui (38)
Rtsne (2)
Rttf2pt1 (1)
Ruchardet (1)
rugarch (1)
runibic (66)
RUnit (1)
runjags (1)
runonce (1)
Runuran (1)
Ruuid (3)
ruv (0)
RUVcorr (47)
RUVnormalize (51)
RUVSeq (856)
RUVseq (1)
Rvcg (1)
rvcheck (1)
RVenn (1)
rversions (53)
rvest (11)
rvg (1)
Rvisdiff (2)
Rvmmin (1)
RVS (36)
RVtests (1)
Rwave (3)
RWebServices (2)
RWiener (1)
rWikiPathways (337)
rworldmap (1)
RxODE (1)
rxode2 (1)
rxode2et (1)
rxode2ll (1)
rxode2parse (1)
rxode2random (1)
Ryacas (1)
rzmq (2)

S

s2 (39)
S4Arrays (15130)
S4Vectors (49818)
s4vectors (1)
saemix (1)
safe (467)
safetyData (1)
safetyexploreR (1)
safetyMarginCalculation (1)
SAGElyzer (2)
sagenhaft (35)
SAGx (8)
SAIGEgds (54)
samExploreR (2)
sampleClassifier (40)
sampleSelection (1)
sampling (1)
samr (4)
SamSPECTRAL (88)
sandwich (3)
sangeranalyseR (154)
sangerseqR (613)
SANTA (58)
sapFinder (2)
saps (1)
SARC (2)
sarks (34)
sas7bdat (1)
SASmixed (1)
sass (117)
satellite (1)
satuRn (165)
savR (53)
SBGNview (86)
SBGNview.data (1)
sbgr (1)
SBMLR (60)
SC3 (415)
sc3 (1)
scagnostics (1)
Scale4C (37)
ScaledMatrix (10612)
scales (16)
scAlign (26)
scalreg (1)
scam (1)
SCAN.UPC (90)
scanMiR (41)
scanMiRApp (46)
scAnnotatR (70)
SCANVIS (53)
SCArray (44)
SCArray.sat (19)
SCATE (42)
scater (5768)
scatterD3 (1)
scatterHatch (43)
scattermore (14)
scatterpie (8)
scatterplot3d (46)
scBFA (39)
SCBN (64)
scBubbletree (37)
scCB2 (38)
scClassifR (2)
scClassify (68)
scclusteval (1)
sccomp (46)
sccore (1)
sccs (1)
scCustomize (0)
scda (1)
scda.2021 (1)
scda.2022 (1)
scDataviz (57)
scDblFinder (1049)
ScDblFinder (1)
scDC (1)
scDD (127)
scDDboost (34)
scde (314)
scDesign3 (3)
scds (458)
SCFA (36)
scFeatureFilter (48)
scFeatures (25)
scfind (2)
scGate (1)
scGPS (42)
schex (122)
scHOT (55)
scico (1)
scidb (1)
scider (2)
scifer (33)
Scillus (1)
ScISI (4)
scistreer (4)
scLinear (1)
scMAGeCK (30)
scmap (316)
scMerge (361)
scMET (37)
scmeth (50)
SCnorm (82)
scone (87)
Sconify (34)
SCOPE (46)
scoreInvHap (34)
scoringRules (1)
scp (97)
scPCA (73)
scPipe (72)
scran (4113)
scReClassify (34)
scRecover (45)
screenCounter (17)
ScreenR (31)
scRepertoire (306)
scrime (4)
scRNAseq (1)
scRNASeq.spatial (1)
scRNAseqApp (23)
scruff (49)
scry (174)
scrypt (1)
scs (1)
scShapes (34)
scsR (2)
scTensor (49)
scTGIF (43)
scTHI (34)
sctransform (12)
scTreeViz (40)
scuttle (8922)
scviewer (1)
scviR (20)
sda (1)
SDAMS (40)
SDMTools (1)
sechm (112)
secrets (0)
see (1)
seewave (0)
segmented (2)
segmenter (34)
segmentSeq (39)
selectKSigs (32)
selectr (1)
SELEX (40)
sem (0)
SemDist (39)
semEff (1)
semisup (45)
SemSim (2)
semsim (1)
semTools (1)
sen2r (1)
sendmailR (1)
sensitivity (1)
sensobol (1)
SEPA (2)
SEPIRA (30)
seq.hotSPOT (16)
seq2pathway (49)
seqArchR (48)
seqArchRplus (19)
SeqArray (735)
seqbias (45)
seqCAT (37)
seqCNA (53)
seqcombo (48)
SeqGate (32)
SeqGSEA (63)
seqinr (1)
seqLogo (2464)
seqminer (7)
Seqnames (0)
seqPattern (551)
seqplots (7)
seqsetvis (49)
SeqSQC (50)
seqTools (96)
sequenza (0)
SeqVarTools (421)
seriation (11)
servr (1)
sesame (471)
sessioninfo (46)
set6 (0)
SEtools (68)
setRNG (1)
sets (1)
settings (1)
Seurat (22)
seurat (1)
SeuratObject (15)
SeuratWrappers (1)
sevenbridges (51)
sevenC (39)
sf (48)
sfheaders (3)
sfsmisc (2)
sftime (1)
SGCP (23)
sgeostat (1)
SGP (1)
SGSeq (234)
shadowtext (1)
shape (3)
shapefiles (1)
shapes (1)
shapr (1)
SharedObject (74)
ShatterSeek (0)
SHELF (1)
shiny (71)
shiny.gosling (0)
shiny.react (1)
shiny.router (1)
shinyAce (1)
shinyalert (0)
shinyauth (0)
shinyBS (7)
shinybusy (1)
shinycssloaders (1)
shinydashboard (2)
shinydashboardPlus (5)
shinydisconnect (1)
shinyEffects (1)
shinyepico (44)
shinyFeedback (1)
shinyfeedback (1)
shinyFiles (9)
shinyglide (1)
shinyhelper (4)
ShinyItemAnalysis (22)
shinyjqui (1)
shinyjs (3)
shinyloadtest (1)
shinyLP (0)
shinymanager (1)
shinyMatrix (1)
shinyMethyl (78)
shinyMobile (1)
shinypanel (5)
shinyscreenshot (1)
shinySelect (1)
shinystan (1)
shinyTANDEM (3)
shinytest (2)
shinytest2 (1)
shinythemes (1)
shinytoastr (1)
shinyTree (1)
shinyvalidate (1)
shinyWidgets (17)
ShortRead (5716)
shortread (0)
showimage (1)
showtext (1)
showtextdb (1)
SIAMCAT (99)
SICtools (32)
SID (1)
sidap (0)
sigaR (4)
SigCheck (38)
sigclust (1)
sigFeature (159)
Sigfried (1)
SigFuge (37)
siggenes (2799)
sights (43)
Signac (7)
signal (0)
signature.tools.lib (0)
signature.tools.lib.back (0)
signature.tools.lib.v2.1 (0)
signature.tools.lib.v2.1.2 (0)
signatureSearch (88)
signeR (62)
signet (3)
signifinder (42)
SignifReg (0)
sigPathway (70)
sigpathway (0)
SigsPack (35)
sigsquared (35)
SIM (40)
SIMAT (36)
SimBindProfiles (37)
SimBu (42)
SimComp (1)
SIMD (34)
simex (1)
SimFFPE (38)
similaRpeak (57)
SIMLR (211)
simona (2)
simpar (1)
simpleaffy (111)
simplermarkdown (1)
simpleSeg (50)
simpleSingleCell (0)
simplifyEnrichment (445)
simputation (1)
SimSeq (0)
simsurv (1)
simulatorAPMS (2)
simulatorZ (3)
sincell (54)
single (37)
SingleCellExperiment (13228)
SingleCelLExperiment (0)
SingleCellSignalR (168)
singleCellTK (195)
SingleMoleculeFootprinting (37)
SingleR (3213)
singleR (1)
SingleRBook (4)
singscore (1004)
SiPSiC (19)
sirnakit (1)
SIS (1)
siscreener (1)
SISPA (40)
sitadela (36)
sitePath (42)
sitmo (6)
sizepower (58)
SJava (2)
sjlabelled (1)
sjmisc (1)
sjPlot (1)
sjstats (1)
SKAT (7)
SkewHyperbolic (1)
skewr (33)
skewt (1)
skimr (1)
skmeans (1)
slackr (1)
slalom (42)
slam (2)
SLGI (3)
slickR (1)
slider (8)
slingshot (1158)
slinky (3)
sloop (1)
SLqPCR (56)
sm (0)
smacof (1)
SMAD (46)
SMAP (51)
smartdata (0)
smcfcs (1)
smfishHmrf (1)
SMITE (44)
smldesign (1)
smoother (0)
smoothHR (0)
smotefamily (1)
SMVar (6)
sn (8)
sna (1)
SNAData (1)
SNAGEE (51)
snakecase (6)
SnapATAC (1)
snapCGH (50)
snapcount (49)
snifter (112)
snm (130)
snow (7)
SnowballC (1)
snowfall (1)
snpAssoc (0)
SNPchip (11)
SNPediaR (44)
SNPhood (37)
SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38 (1)
snpMatrix (5)
snpmatrix (0)
snpMatrix2 (0)
SNPRelate (1395)
snpStats (1948)
SOAR (0)
sodium (1)
softImpute (1)
soGGi (281)
soilDB (1)
sojourner (15)
solrium (1)
som (1)
SomaDataIO (0)
SomatiCA (1)
SomaticSignatures (135)
SomaVarDB (1)
SOMbrero (1)
sommer (1)
SOMNiBUS (45)
sortable (1)
sos (1)
soundecology (0)
SoupX (1)
sourcetools (32)
sp (37)
spacefillr (1)
SpacePAC (37)
spacetime (1)
SPACox (0)
spade (4)
spam (2)
spam64 (1)
spaMM (1)
Spaniel (61)
sparkline (1)
sparklyr (8)
SPARQL (1)
sparrow (104)
SparseArray (1579)
sparsebn (1)
sparseDOSSA (51)
SparseGrid (1)
SparseM (1)
sparseMatrixStats (13586)
sparsenetgls (47)
sparsepca (1)
SparseSignatures (44)
sparsesvd (12)
spaSim (33)
spatial (14)
SpatialCPie (65)
spatialDE (76)
SpatialDecon (134)
SpatialExperiment (1027)
SpatialFeatureExperiment (102)
spatialHeatmap (54)
SpatialOmicsOverlay (24)
spatialreg (1)
spatstat (1)
spatstat.core (8)
spatstat.data (8)
spatstat.explore (8)
spatstat.geom (15)
spatstat.linnet (1)
spatstat.model (1)
spatstat.random (15)
spatstat.sparse (12)
spatstat.utils (12)
spatzie (35)
spd (1)
spData (3)
spdep (1)
spec (1)
speckle (56)
specL (56)
SpeCond (57)
spectacles (1)
Spectra (746)
SpectralTAD (73)
speedglm (1)
SPEI (1)
spelling (1)
SPEM (50)
spgs (1)
SPIA (511)
SPIAT (68)
spicyR (119)
SpidermiR (58)
spikeLI (44)
spiky (38)
spkTools (35)
splancs (3)
splatter (352)
splicegear (2)
spliceR (8)
spliceSites (3)
SpliceWiz (53)
SplicingFactory (34)
SplicingGraphs (65)
splines (0)
splines2 (1)
splineTCDiffExpr (1)
splineTimeR (58)
SPLINTER (34)
splitTools (0)
splots (131)
spls (1)
splus2R (1)
SPONGE (72)
SpotClean (65)
SPOTlight (171)
spotSegmentation (2)
spqn (41)
spsComps (1)
SPsimSeq (61)
SQLDataFrame (37)
sqldf (1)
SQUADD (45)
SQUAREM (1)
sRACIPE (48)
SRAdb (316)
sRAP (4)
SRGnet (2)
srnadiff (23)
sROC (0)
ssanv (1)
sscore (36)
sscu (38)
sSeq (118)
ssh.utils (0)
ssize (84)
sSNAPPY (52)
SSPA (68)
ssPATHS (32)
ssrch (52)
ssviz (44)
stabledist (1)
stabs (1)
stageR (173)
stam (1)
STAN (24)
standR (67)
StanHeaders (5)
staRank (34)
StarBioTrek (42)
stargazer (1)
Starr (2)
stars (1)
starter (1)
startupmsg (0)
STATegRa (44)
Statial (41)
statmod (2)
statnet (1)
statnet.common (1)
stats (0)
stats4 (0)
statsExpressions (1)
statTarget (90)
STdeconvolve (82)
stdReg (1)
stepNorm (37)
stepwiseCM (2)
stevedore (1)
sticky (1)
stinepack (1)
stJoincount (42)
stopwords (1)
storr (1)
strandCheckR (39)
Streamer (40)
strex (1)
string (0)
STRINGdb (887)
stringdist (7)
stringfish (1)
stringi (31)
stringr (39)
striprtf (1)
STROMA4 (34)
strucchange (1)
struct (104)
Structstrings (68)
structToolbox (79)
StructuralVariantAnnotation (150)
styler (16)
SubCellBarCode (40)
subplex (1)
subselect (1)
subSeq (57)
SUITOR (32)
SummarizedBenchmark (41)
SummarizedExperiment (34160)
summarizedExperiment (0)
summarytools (1)
Summix (45)
sunburstR (1)
superheat (1)
SuperLearner (1)
superpc (1)
supersigs (38)
SuppDists (1)
supraHex (340)
surfaltr (39)
survcomp (881)
survey (1)
survival (82)
survivalROC (1)
survminer (1)
survMisc (1)
survPen (1)
survPresmooth (1)
survtype (44)
Sushi (70)
susieR (12)
sva (6432)
svaNUMT (35)
SVAPLSseq (2)
svaRetro (35)
svd (1)
svDialogs (1)
svglite (10)
svGUI (1)
SVM2CRM (2)
SVMDO (21)
svUnit (1)
swagger (1)
SWATH2stats (48)
SwathXtend (53)
swfdr (49)
Swiffer (1)
SwimR (2)
swirl (1)
switchBox (91)
switchde (40)
sybil (1)
sybilGUROBI (1)
sybilSBML (1)
sylly (1)
sylly.en (1)
symengine (1)
symphony (1)
synapsis (35)
synapter (58)
synergyfinder (176)
SynExtend (42)
synlet (38)
SynMut (36)
syntenet (64)
sys (130)
sysfonts (1)
systemfit (1)
systemfonts (13)
systemPipeR (1105)
systemPipeRdata (0)
systemPipeShiny (60)
systemPipeTools (43)
syuzhet (1)

T

table1 (1)
tableHTML (1)
tableone (1)
tables (2)
tadar (2)
TADCompare (63)
TailRank (2)
tanggle (53)
TAPseq (46)
tarchetypes (3)
target (38)
TargetDecoy (35)
targets (3)
TargetScore (56)
TargetSearch (62)
targetsearch (0)
TarSeqQC (21)
taxize (1)
TBSignatureProfiler (47)
TCC (180)
TCGAbiolinks (2981)
TCGAbiolinksGUI (53)
TCGAbiolinksGUI.data (1)
TCGAutils (707)
tcltk (0)
tcltk2 (1)
tclust (1)
TCseq (120)
TDARACNE (16)
tdaracne (0)
TDbasedUFE (29)
TDbasedUFEadv (30)
TeachingDemos (1)
teal (1)
teal.modules.clinical (0)
teal.modules.general (0)
teal.widgets (1)
TEKRABber (42)
templater (0)
tensor (1)
tensorA (1)
tensorflow (8)
TENxIO (38)
TENxPBMCData (1)
tenXplore (35)
TEQC (51)
tergm (1)
tern (1)
ternarynet (37)
terra (48)
terraTCGAdata (34)
tesseract (1)
testit (1)
testthat (161)
texreg (1)
textshaping (10)
TFARM (32)
tfautograph (1)
TFBSTools (2071)
tfbstools (1)
tfdatasets (1)
TFEA.ChIP (52)
TFHAZ (31)
TFisher (1)
TFMPvalue (6)
tfrmt (1)
tfruns (7)
TFutils (47)
tgp (1)
tgxWebservices (1)
TH.data (2)
thematic (1)
themis (1)
this.path (1)
threejs (1)
tibble (136)
tictoc (2)
tidybayes (1)
tidybulk (155)
tidycensus (13)
tidyclust (1)
tidycmprsk (1)
tidygraph (3)
tidyjson (0)
tidylog (1)
tidymodels (5)
tidyposterior (1)
tidyr (30)
tidyrules (1)
tidyselect (20)
tidySEM (1)
tidyseurat (1)
tidySingleCellExperiment (135)
tidySummarizedExperiment (209)
tidytext (1)
tidytlg (1)
tidytree (16)
tidyTree (1)
tidyverse (11)
tidyvpc (1)
tidyxl (0)
tiff (1)
tiger (0)
tigre (44)
tigris (13)
tikzDevice (1)
TileDBArray (37)
tilingArray (68)
timechange (3)
timecourse (53)
timeDate (9)
timeOmics (58)
timereg (1)
TimerQuant (0)
timescape (75)
timeSeries (1)
TimeSeriesExperiment (7)
timetk (1)
TimiRGeN (50)
Timma (1)
TIN (40)
TINC (0)
tinkr (1)
tinysnapshot (1)
tinytest (1)
tinytex (106)
tippy (1)
tis (1)
TissueEnrich (90)
TitanCNA (59)
titanic (1)
tkrgl (0)
tkrplot (1)
tkWidgets (1100)
tkwidgets (0)
tLOH (33)
tm (1)
tmap (1)
TMB (1)
TMixClust (51)
tmle (1)
tmvnsim (1)
tmvtnorm (0)
TNBC.CMS (39)
TnT (39)
TOAST (287)
toastui (1)
tofsims (3)
tokenizers (1)
tokupika (1)
tolerance (1)
tomoda (31)
tomoseqr (32)
tools (0)
toOrdinal (1)
TOP (17)
ToPASeq (3)
topconfects (141)
topdownr (44)
topGO (2721)
topicmodels (0)
torch (1)
ToxicoGx (40)
Tplyr (1)
TPP (73)
TPP2D (41)
tracee (1)
tracktables (131)
trackViewer (338)
trackviewer (0)
tradeSeq (409)
TrajectoryGeometry (42)
TrajectoryUtils (1381)
tram (1)
TraMineR (0)
transcriptogramer (48)
transcriptR (43)
transformGamPoi (44)
transformr (1)
transite (41)
tRanslatome (46)
transomics2cytoscape (35)
transport (1)
TransView (39)
TraRe (13)
traseR (38)
Travel (15)
traviz (39)
tree (1)
TreeAndLeaf (101)
treeio (17475)
treekoR (37)
treemap (1)
treespace (1)
TreeSummarizedExperiment (1171)
TREG (38)
TReNA (1)
trena (44)
Trendy (47)
TRESS (46)
triangle (1)
tricycle (111)
triebeard (1)
triform (3)
trigger (37)
trimcluster (0)
trio (76)
tripack (1)
triplex (40)
tripr (51)
tRNA (61)
tRNAdbImport (45)
tRNAscanImport (53)
TRONCO (54)
trtf (1)
truncdist (1)
truncnorm (4)
truncreg (1)
trust (0)
TSAR (2)
TSCAN (444)
tscR (41)
tseries (1)
tseriesChaos (0)
tsfeatures (1)
tsModel (1)
tsna (0)
tsne (1)
TSP (12)
tspair (5)
TSRchitect (4)
TSSi (2)
ttdo (1)
ttgsea (50)
TTMap (34)
TTR (1)
ttservice (1)
tufte (1)
tune (8)
tuneR (0)
TurboNorm (38)
TVTB (35)
twang (0)
twangContinuous (1)
tweeDEseq (86)
tweedie (1)
tweenr (3)
twilight (81)
twoddpcr (40)
TwoSampleMR (0)
twosamples (1)
txcutr (34)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene (5)
TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene (1)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGene (0)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.knownGene (5)
TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene (1)
tximeta (1063)
tximport (3226)
tximportDat (1)
tximportData (1)
TxRegInfra (2)
txtq (1)
TypeInfo (47)
tzdb (53)

U

uatools (1)
UCell (888)
uchardet (0)
ucminf (1)
udunits2 (1)
Ularcirc (37)
umap (7)
UMI4Cats (42)
unbalanced (0)
uncoverappLib (33)
UNDO (56)
unifiedWMWqPCR (37)
UniProt.ws (342)
uniqueAtomMat (0)
Uniquorn (36)
unitizer (1)
units (40)
universalmotif (427)
unmarked (1)
updateObject (35)
UpSetR (1)
urca (1)
urlchecker (1)
urltools (1)
uroot (0)
useful (0)
usethis (66)
usmap (0)
usmapdata (0)
uSORT (35)
UTAR (0)
utf8 (80)
utils (1)
utilsRmd (1)
uuid (20)
uwot (21)

V

V8 (8)
VAExprs (35)
validate (1)
VanillaICE (70)
vaplot (1)
vapour (0)
VarCon (36)
variables (1)
variancePartition (666)
VariantAnnotation (8041)
VariantExperiment (43)
VariantFiltering (52)
VariantTools (101)
varImp (1)
vars (1)
vasp (1)
VaSP (35)
vaultr (0)
vbmp (60)
VBsparsePCA (1)
vcd (1)
VCFArray (38)
vcfR (0)
vcr (1)
vctrs (158)
vdbR (1)
vdiffr (1)
VDJdive (36)
Vega (2)
VegaMC (39)
vegan (2)
vegawidget (1)
velociraptor (100)
veloviz (53)
vembedr (1)
vendormetadatahelpers (1)
venn (6)
VennDetail (186)
VennDiagram (1)
venneuler (1)
VERSO (46)
VGAM (6)
VGAMextra (0)
vhydeg (1)
VIBER (0)
vidger (85)
VIM (1)
VineCopula (1)
vioplot (1)
vip (1)
viper (606)
vipor (1)
viridis (55)
viridisLite (77)
viridislite (1)
virtualArray (3)
visdat (1)
ViSEAGO (111)
visNetwork (2)
visR (1)
vissE (77)
vistime (0)
Voyager (69)
vpc (1)
VplotR (49)
vroom (60)
vscDebugger (1)
vsclust (39)
vsn (4709)
vtpnet (37)
vulcan (38)

W

waddR (41)
waffle (0)
waiter (5)
wakefield (1)
waldo (69)
warp (1)
wateRmelon (698)
wavClusteR (43)
waveslim (0)
waveTiling (3)
wdm (1)
wdman (1)
weaver (55)
webbioc (41)
webchem (1)
webdriver (1)
webfakes (1)
WebGestaltR (1)
webmockr (1)
webp (1)
webshot (16)
webshot2 (1)
websocket (1)
webutils (1)
WeightIt (1)
weights (2)
WeightSVM (0)
weitrix (37)
WES.1KG.WUGSC (1)
wesanderson (1)
WGCNA (6)
WGScan (1)
WGSmapp (0)
whereami (1)
whisker (72)
whitening (1)
whoami (1)
widgetInvoke (1)
widgetTools (1117)
widgettools (0)
wiggleplotr (116)
WikidataQueryServiceR (1)
WikidataR (1)
WikipediR (1)
wikitaxa (1)
wildmeta (1)
winboxr (1)
withr (53)
wk (54)
wordcloud (1)
wordcloud2 (1)
workflowr (1)
workflows (7)
workflowsets (4)
worrms (1)
wpm (46)
wppi (39)
Wrench (1270)
writexl (2)
WriteXLS (1)
WRS2 (1)

X

xaringan (1)
xaringanExtra (1)
xaringanthemer (1)
xbioc (1)
XBSeq (2)
XCIR (2)
xcms (1466)
xcore (38)
XDE (40)
xdg-utils (1)
Xeva (39)
xfun (169)
xgboost (5)
xgxr (1)
XINA (37)
XLConnect (1)
xlsx (1)
xlsxjars (1)
xmapbridge (46)
xmapcore (2)
XML (17)
xml2 (124)
xmlparsedata (1)
XNAString (40)
xopen (1)
xpose (1)
xpose.nlmixr2 (1)
xpose4 (1)
xps (5)
xrf (1)
xslt (1)
xtable (2)
xts (3)
XVector (42327)
xvector (0)
XVectorb (0)

Y

y2hStat (1)
yaImpute (1)
yaml (84)
yamss (44)
YAPSA (60)
yaqcaffy (4)
yardstick (7)
yarn (94)
ymlthis (0)
yspec (1)
yulab.utils (17)

Z

zCompositions (5)
zeallot (1)
zellkonverter (798)
zenith (59)
zFPKM (104)
zinbwave (664)
zip (91)
Ziploc (1)
zlibbioc (43312)
zoo (16)
ZygosityPredictor (15)